Информатика биоизображений
-
Основы информатики биоизображений
- Информатика биоизображений — это область, которая использует методы компьютерного зрения для анализа биологических изображений.
- Она включает в себя обработку изображений, классификацию, сегментацию, отслеживание и регистрацию.
-
Методы обработки изображений
- Методы обработки изображений включают в себя анализ субклеточного расположения, скрининг с высоким содержанием контента, сегментацию и отслеживание.
- Они используются для изучения клеточной биологии, разработки лекарств и фундаментальных биологических исследований.
-
Проблемы и решения
- Анализ субклеточного расположения является одной из первых задач информатики биоизображений.
- Высокопроизводительные скрининги с использованием автоматизированной технологии являются стандартным методом.
- Сегментация клеток является важной задачей для обработки изображений и изучения экспрессии генов.
- Отслеживание объектов в изображениях является традиционной проблемой, особенно в флуоресцентной визуализации.
- Регистрация изображений необходима для лучшего сравнения данных, полученных из разных источников.
-
Важность и развитие
- Информатика биоизображений имеет важное значение для фундаментальных исследований и разработки лекарств.
- Ежегодные совещания и конференции по информатике биоизображений способствуют обмену знаниями и развитию методов.
-
Программное обеспечение
- Существуют графические интерфейсы и платформы для визуализации и анализа изображений, такие как ImageJ и Vaa3D.
- Исследователи разрабатывают собственные методы, используя языки программирования с поддержкой компьютерного зрения, такие как Python и MATLAB.