SARS-CoV-2
-
Происхождение и классификация SARS-CoV-2
- SARS-CoV-2 — штамм коронавируса, вызывающий COVID-19.
- Первоначально назывался 2019-nCoV, затем HCoV-19.
- Относится к виду Betacoronavirus pandemicum.
- Имеет зоонозное происхождение, возможно, от летучих мышей.
-
Эпидемиология и передача
- Впервые выявлен в Ухане, Китай.
- ВОЗ объявила пандемию с 30 января 2020 года по 5 мая 2023 года.
- Передается через респираторные капли и аэрозоли.
- Вступает в клетки через рецептор ACE2.
-
Терминология и названия
- Первоначально назывался «2019-nCoV» и «Wuhan coronavirus».
- В феврале 2020 года принят термин «SARS-CoV-2».
- ВОЗ иногда использует «COVID-19 вирус» для избежания путаницы.
-
Инфекция и симптомы
- Передача от человека к человеку подтверждена с 20 января 2020 года.
- Пик вирусной нагрузки в горле через 4 дня после заражения.
- Вирус может выживать на поверхностях до 3 дней.
- Симптомы варьируются от легких до тяжелых, включая пневмонию.
-
Асимптоматическая и пресимптоматическая передача
- ВОЗ считает, что передача от бессимптомных случаев не является основным фактором.
- Некоторые исследования указывают на возможность пресимптоматической передачи.
- Исследования показывают, что вирус может выделяться до появления симптомов.
-
Реинфекция и иммунитет
- Неизвестна частота реинфекции и долгосрочный иммунитет.
- Реинфекция может происходить с разной степенью тяжести.
-
Реинфекция SARS-CoV-2
- Первый случай реинфекции зафиксирован у 33-летнего мужчины из Гонконга.
- Второй случай реинфекции у 25-летнего мужчины из Невады.
- Геномные анализы показали различия между двумя случаями.
-
Происхождение и резервуар
- Естественный резервуар SARS-CoV-2 не выявлен.
- Первые случаи заражения обнаружены в Ухане, Китай.
- Источник передачи вируса остается неясным.
- Вирус мог передаться через рынок морепродуктов Хуанань.
-
Эволюция и генетика
- SARS-CoV-2 быстро эволюционирует, но медленнее, чем грипп.
- Вирус имеет высокую генетическую пластичность.
- Вирусы, подобные SARS-CoV-2, обнаружены у летучих мышей.
-
Филогенетика и таксономия
- SARS-CoV-2 относится к семейству коронавирусов.
- Вирус имеет полиbasic сайт, который способствует его вирулентности.
- Вирус был идентифицирован как SARS-CoV-2-related coronavirus.
-
Филогенетическое дерево
- Вирус имеет сходство с другими коронавирусами.
- Вирус может передаваться через промежуточных хозяев.
- Вирус не имеет прямого предка среди известных коронавирусов.
-
Варианты SARS-CoV-2
- Существует множество вариантов SARS-CoV-2, которые можно сгруппировать в клады.
- ВОЗ объявила пять вариантов, вызывающих беспокойство: E484K, Beta, Gamma, Delta и Omicron.
- Другие варианты включают Cluster 5, который вызвал кампанию по эвтаназии норок в Дании.
-
Структура вируса
- Вирион SARS-CoV-2 имеет диаметр 60-140 нанометров и массу от 0.1 до 10 кг.
- Вирус содержит четыре структурных белка: S, E, M и N.
- S-белок отвечает за прикрепление и слияние с мембраной клетки.
-
Геном и репликация
- Геном SARS-CoV-2 состоит из 30,000 оснований и имеет линейный, одноцепочечный РНК.
- Вирус имеет высокую аффинность к рецептору ACE2 на клетках человека.
- Вирус использует TMPRSS2 для входа в клетку и высвобождает РНК, заставляя клетку производить новые копии вируса.
-
Лечение и разработка лекарств
- Существует мало эффективных лекарств против SARS-CoV-2.
- Маситиниб показал значительное снижение вирусных титров у мышей, но не одобрен для лечения людей.
- В декабре 2021 года США и другие страны одобрили использование Nirmatrelvir/ritonavir для лечения вируса.
-
Эпидемиология
- В Ухане не было значительного распространения вируса в 2019 году.
- Базовый репродуктивный индекс вируса составляет от 2.39 до 3.44.
- В Китае подтверждено около 96,000 случаев инфекции, из которых 75,815 случаев в Ухане.
- По состоянию на 10 марта 2023 года, всего подтверждено 676,609,955 случаев и 6,881,955 смертей.