Индекс разнообразия
-
Индексы разнообразия
- Измеряют количество различных типов в наборе данных
- Учитывают филогенетическое родство между видами
- Полезны для сравнения сообществ или сайтов
-
Эффективное число видов
- Число одинаково распространенных видов, необходимое для среднего пропорционального количества видов
- Рассчитывается как взвешенное обобщенное среднее значение пропорционального количества видов
-
Истинное разнообразие
-
Порядок разнесения
- Определяет чувствительность истинного разнообразия к редким и многочисленным видам
- q = 0 соответствует взвешенному среднему значению гармоники
- q = 1 соответствует взвешенному среднему геометрическому значению
- q = 2 соответствует средневзвешенному арифметическому значению
-
Богатство
- Количество различных типов в наборе данных
- Часто используется в экологии из-за доступности данных о численности
-
Индекс Шеннона
- Количественно определяет энтропию в текстовых строках
- Рассчитывается как логарифм истинного разнообразия при q = 1
- Связан со средневзвешенным геометрическим значением пропорциональной распространенности видов
-
Энтропия Реньи
- Обобщение энтропии Шеннона на другие значения q
- Рассчитывается как логарифмирование истинного разнообразия при любом значении q
-
Индекс Симпсона
- Мера концентрации, когда индивиды классифицируются по типам
- Рассчитывается как вероятность того, что два объекта представляют один и тот же тип
- Взвешенное среднее арифметическое пропорционального содержания pi
-
Сравнение уравнений для λ и истинного разнесения
- 1/λ равно 2D при q = 2
- Исходный индекс Симпсона равен базовой сумме
-
Интерпретация λ
- Вероятность того, что два объекта представляют один и тот же тип
- В небольших наборах данных разница между выборкой с заменой и без замены может быть существенной
-
Индекс Хантера–Гастона
- В микробиологии λ известен как индекс Хантера–Гастона
- Вероятность получения одного и того же типа при двух случайных розыгрышах равна ni/N
-
Противоречие с здравым смыслом
- λ получает малые значения в наборах данных с высоким разнообразием и большие значения в наборах данных с низким разнообразием
- Используются преобразования λ, увеличивающиеся с увеличением разнообразия
-
Обратный индекс Симпсона
- Равен истинному разнообразию порядка 2
- Используется как показатель фактического числа партий
-
Индекс Джини–Симпсона
- Вероятность того, что два объекта представляют разные типы
- Известен как вероятность межвидовой встречи (PIE)
- Может быть выражен как преобразование истинного разнообразия 2-го порядка
-
Индекс Гиббса–Мартина
- Тот же показатель, что и индекс Джини–Симпсона
- В популяционной генетике известен как ожидаемая гетерозиготность
-
Индекс Бергера–Паркера
- Соответствует пропорциональному обилию наиболее распространенного вида
- Равен величине, обратной истинному разнообразию бесконечного порядка
-
Другие индексы разнообразия
- Альфа-разнообразие, бета-разнообразие, культурное разнообразие
- Эффективное число партий, гамма-разнообразие, обобщенный показатель энтропии
- Коэффициент Джини, индекс изоляции, измерение биоразнообразия
- Качественные различия, относительное изобилие, видовое разнообразие, видовое богатство