Пять основных непереведенных регионов
-
Структура и функции 5′-UTR
- 5′-UTR находится перед инициирующим кодоном мРНК
- Важен для регуляции трансляции у вирусов, прокариот и эукариот
- Может быть полностью непереведенным или образовывать вторичную структуру
-
Элементы 5′-UTR
- Прокариотический 5′-UTR содержит сайт связывания с рибосомой (RBS)
- Эукариотический 5′-UTR содержит консенсусную последовательность Козака и цис-действующие регуляторные элементы
- Эукариотические 5′-UTR могут содержать интроны
-
Вторичная структура 5′-UTR
- Высокое содержание GC приводит к образованию вторичных структур
- Петли для шпилек и другие структуры влияют на регуляцию трансляции
-
Роль в регуляции трансляции у прокариот
- Инициация трансляции происходит через связывание IF-3 с RBS
- У архей инициация менее понятна, но также зависит от отсутствия вторичной структуры
-
Регуляция трансляции у эукариот
- Комплексное регулирование включает eIF4F, eIF4E и eIF4G
- РНК-связывающие белки могут предотвращать образование комплекса
- Взаимодействие между 3′ и 5′ UTR может препятствовать трансляции
-
Регулирование уровня ферритина
- 5′-UTR образует вторичную структуру, распознаваемую белками IRP1 и IRP2
- При низком содержании железа ORF блокируется, при высоком — экспрессируется
-
Операции и повторная инициация
- uORF содержат свой инициирующий кодон (uAUG)
- uORF могут регулировать трансляцию основной кодирующей последовательности
- Повторной инициация уменьшает трансляцию белка ORF
-
Другие механизмы регуляции
- uORF могут кодировать кодон, останавливающий работу рибосомы
- Взаимодействие с сайтами IRES и сайтами проникновения во внутренние рибосомы
-
Роль в регуляции транскрипции
- Транскрипция msl-2 регулируется сайтами связывания для Sxl
- Sxl подавляет трансляцию msl2 и усиливает трансляцию uORF
-
Белок, связывающий элементы, чувствительные к железу
- Белок, связывающий элементы, чувствительные к железу, играет важную роль в организме.
- Он участвует в различных процессах, связанных с железом.
-
Железный реагирующий элемент
- Железный реагирующий элемент является частью белка, связывающего элементы, чувствительные к железу.
- Он взаимодействует с железом и участвует в различных биологических процессах.
-
Транс-сращивание
- Транс-сращивание является процессом, при котором два или более белка связываются вместе.
- Это может происходить в различных частях организма, таких как клетки, ткани или органы.
-
UTRdb — База данных
- UTRdb является базой данных, содержащей информацию о различных белках и их функциях.
- Она помогает исследователям лучше понимать биологические процессы и их взаимодействие с различными элементами.
-
Рекомендации
- В статье даются рекомендации по использованию белка, связывающего элементы, чувствительные к железу.