Рибонуклеаза
-
Рибонуклеазы: определение и классификация
- Рибонуклеазы (РНКазы) катализируют расщепление РНК на более мелкие компоненты.
- РНКазы делятся на эндорибонуклеазы и экзорибонуклеазы.
- Эндорибонуклеазы включают РНКазу А, РНКазу Н, РНКазу III и другие.
- Экзорибонуклеазы включают полинуклеотидфосфорилазу, РНКазу PH и другие.
-
Функции РНКаз
- РНКазы участвуют в деградации клеточной РНК и созревании всех молекул РНК.
- Они защищают от РНК-вирусов и обеспечивают базовый механизм для RNAi.
- Некоторые клетки выделяют неспецифические РНКазы, такие как А и Т1.
-
Защита РНК от РНКаз
- Внутриклеточные РНК защищены от активности РНКаз с помощью различных стратегий, включая кэпирование, полиаденилирование и образование дуплекса.
- Ингибитор рибонуклеазы (RI) используется для защиты образцов РНК от деградации.
-
Классификация эндорибонуклеаз
- РНКаза А: используется в научных исследованиях, расщепляет 3′-конец РНК.
- РНКаза Н: расщепляет РНК в дуплексе ДНК/РНК, образует 5′-фосфорилированный продукт.
- РНКаза III: расщепляет рРНК и dsRNA, участвует в регуляции транскрипции.
- РНКаза L: индуцируемая интерфероном нуклеаза, разрушает всю РНК в клетке.
- РНКаза Р: рибозим, отщепляет лидерную последовательность от пре-тРНК.
- РНКаза PhyM: расщепляет 3′-конец неспаренных остатков A и U.
- РНКаза T1: расщепляет 3′-конец неспаренных G-остатков.
- РНКаза Т2: расщепляет 3′-конец всех 4 остатков, предпочтительно 3′-конец As.
- РНКаза U2: расщепляет 3′-конец неспаренных А-остатков.
- РНКаза V: специфична для полиадениновой и полиуридиновой РНК.
- РНКаза Е: модулирует реакции SOS у бактерий, активирует механизм SOS.
- РНКаза G: участвует в обработке 16′-конца 5s рРНК, регулирует формирование аксиальных нитей цитоплазмы.
-
Классификация экзорибонуклеаз
- Полинуклеотидфосфорилаза: функционирует как экзонуклеаза и нуклеотидилтрансфераза.
- РНКаза PH: функционирует как экзонуклеаза и нуклеотидилтрансфераза.
- РНКаза R: разрушает РНК с помощью вторичных структур.
- РНКаза D: участвует в процессинге пре-тРНК.
- РНКаза Т: способствует созреванию стабильных РНК.
- Олигорибонуклеаза: расщепляет короткие олигонуклеотиды.
- Экзорибонуклеаза I: расщепляет одноцепочечную РНК с 5′-на 3′-.
- Экзорибонуклеаза II: близкий гомолог экзорибонуклеазы I.
-
Специфичность РНКаз
- Активный участок РНКаз имеет рифтовую долину, обеспечивающую идеальное взаимодействие с остатками.
- Система CRISPR/Cas может расщеплять ssRNA специфичным для последовательности образом.
-
Загрязнение РНКазами
- Извлечение РНК осложняется присутствием РНКаз, разрушающих образцы.
- Некоторые РНКазы могут быть чрезвычайно стойкими и инактивируются сложнее, чем ДНКазы.
- РНКазы выполняют внеклеточные функции, такие как защита от патогенов.
-
Рекомендации и источники
- Ахмед ТАЕ, Уденигве К.К., Гомаа А. Применение биотехнологий и биоинженерии для получения биоматериалов из яиц.
- Д’Алессио Дж. и Риордан Дж. Ф. Рибонуклеазы: структуры и функции.
- Гердес К., Кристенсен С.К. и Лобнер-Олесен А. Локусы стрессовой реакции на прокариотические токсины и антитоксины.