Структурный мотив
-
Структурный мотив в биологических молекулах
- Структурный мотив — это общая трехмерная структура, появляющаяся в различных молекулах.
- Мотив не обязательно связан с мотивом последовательности.
- В нуклеиновых кислотах мотивы могут иметь биологическое значение.
-
Структурные мотивы в белках
- В белках мотив описывает связь между вторичными структурными элементами.
- Мотив обычно состоит из нескольких элементов, например, «спираль-поворот-спираль».
- Пространственная последовательность элементов может быть идентичной, но они могут быть закодированы в любом порядке.
- Белковые мотивы часто включают петли переменной длины и неопределенной структуры.
- Структурные мотивы могут появляться в виде тандемных повторов.
-
Дополнительные ресурсы
- База данных PROSITE по семействам и доменам белков.
- Структурная классификация белков SCOP.
- Соответствие архитектуры и топологии класса CATH.
- ФССП ФССП.
- PASS2 PASS2 — Выравнивания белков как структурные суперсемейства.
- SMoS SMoS — База данных структурных мотивов суперсемейства.
- S4 S4: Сервер для разработки мотивов сверхвысокой вторичной структуры.