Тройная спираль
-
Структура тройной спирали
- Тройная спираль состоит из трех конгруэнтных спиралей с одной осью.
- Каждая спираль находится на одинаковом расстоянии от оси.
- Примеры: триплексная ДНК, триплексная РНК, коллагеновая спираль.
-
Типы тройных спиралей
- Тройная спираль коллагена состоит из трех коллагеновых пептидов.
- Тройная спираль ДНК состоит из трех нитей ДНК.
- Тройная спираль РНК образуется из одноцепочечной РНК и дуплекса РНК.
-
Стабилизирующие факторы
- Коллагеновая тройная спираль стабилизируется гидроксипролином и водородными связями.
- Тройные спирали ДНК и РНК стабилизируются водородными связями и гидрофобным эффектом.
-
Биологическая роль
- Коллагены обеспечивают прочность и стабильность внеклеточного матрикса.
- ДНК может инактивировать ген или индуцировать мутации.
- РНК участвует в стабилизации, трансляции, связывании лигандов и катализе.
-
Вычислительные инструменты
- TDF (Триплексный поиск доменов) прогнозирует потенциал образования триплексов РНК-ДНК.
- Triplexfpp использует методы глубокого обучения для предсказания триплексообразующей lncRNA.