Bioinformatics software

Вики

Розалинда (образовательная платформа)

/

Розалинда (образовательная платформа) Обзор Rosalind Rosalind – образовательный ресурс для изучения биоинформатики через задачи и программирование.  Пользователи изучают биоинформатику через […]

Вики

TopHat (биоинформатика)

/

TopHat (биоинформатика) Обзор инструмента TopHat TopHat – это биоинформатический инструмент для выравнивания последовательностей кДНК, полученных с помощью RNA-Seq.  Он использует

Вики

SAMtools

/

Самодельные инструменты Обзор SAMtools SAMtools – это набор инструментов для обработки коротких последовательностей ДНК в форматах SAM, BAM и CRAM. 

Вики

ХММЕР

/

ХММЕР Обзор программного пакета HMMER HMMER – бесплатный инструмент для анализа последовательностей, разработанный Шоном Эдди.  Используется для идентификации гомологичных белков

Вики

ЭМБОСС

/

ТИСНЕНИЕ Обзор программного пакета EMBOSS EMBOSS – бесплатный пакет для анализа на языке C, разработанный для молекулярной биологии и биоинформатики. 

Вики

АльфаФолд

/

Альфа-фолд Основные достижения AlphaFold AlphaFold 2 предсказывает структуру белков с точностью до 96,2%  AlphaFold 2 превосходит предыдущие модели в предсказании

Вики

Клюкор

/

Qlucore (Клукор) Основание и развитие Qlucore Qlucore – шведская компания, основанная в 2007 году для обработки биоинформационных данных.  Проект начался

Вики

Цитоскейп

/

Цитоскейп Обзор Cytoscape Платформа для визуализации молекулярных взаимодействий с поддержкой экспрессии генов  Включает плагины для сетевого анализа, молекулярного профилирования и

Вики

IMOD (программное обеспечение)

/

IMOD (программное обеспечение) Обзор пакета программ IMOD IMOD – кроссплатформенный пакет для моделирования и обработки изображений с открытым исходным кодом. 

Вики

eTBLAST

/

ВЗРЫВ ETB eTBLAST – бесплатный сервис для поиска сходства текстов, разработанный в 2005 году.  eTBLAST использовал алгоритм гибридного поиска для

Вики

AlphaFold

/

Альфа-фолд AlphaFold – алгоритм предсказания структуры белков, разработанный Google DeepMind.  Алгоритм использует глубокое обучение для предсказания структуры белков на основе