Оглавление
Алгоритм ранжирования страниц в биохимии
-
Применение PageRank в биохимии
- PageRank используется для ранжирования веб-сайтов в поисковых системах, но также применяется в биохимии.
- Алгоритм PageRank оценивает важность веб-сайта, основываясь на количестве и качестве ссылок.
-
Анализ белковых сетей
- PageRank может использоваться для выявления новых лекарственных мишеней в белках.
- Алгоритм, основанный на PageRank, лучше идентифицирует важные белковые мишени, чем метод, учитывающий только количество входящих ребер.
-
Клиническое применение
- Разработка новых лекарств против патогенов является важной задачей из-за развития резистентности к антибиотикам.
- Поиск новых лекарственных мишеней в патогенах может привести к созданию новых лекарств.
-
Доступность данных
- Доступность биологических сетей упрощает поиск новых лекарственных мишеней.
- Алгоритмы анализа ссылок, такие как PageRank, могут использоваться для выбора важных узлов в метаболических сетях.
-
Персонализированный PageRank
- PageRank отражает личный интерес веб-серферов, но в метаболических сетях он соответствует белкам.
- Персонализированный PageRank может идентифицировать связанные с заболеванием белки.
-
Релятивизированный персонализированный PageRank
- Релятивизированный персонализированный PageRank учитывает количество ребер, указывающих на узел, для оценки его важности.
- Этот метод позволяет находить важные узлы, не являющиеся концентраторами.
-
Примеры применения
- PageRank использовался для обнаружения уже проверенных и новых лекарственных мишеней, например, в микобактерии туберкулеза.
Полный текст статьи: