Оглавление
Анализ функциональных нейровизуализаций
-
Обзор AFNI
- AFNI – это среда с открытым исходным кодом для анализа данных МРТ.
- Включает программы для интерактивной и пакетной обработки данных.
- Разработана NIMH и постоянно совершенствуется.
- Работает на многих Unix-подобных ОС, доступны предварительно скомпилированные двоичные файлы.
-
История и развитие
- AFNI был создан в 1994 году в Медицинском колледже Висконсина.
- Представлен в NIH в 2001 году и продолжает развиваться.
- Изначально требовались сложные командные сценарии, но со временем появились GUI и пакетные сценарии.
-
Особенности AFNI
- Улучшает стандартизацию данных МРТ, преобразуя индивидуальные снимки в стандартизированное пространство.
- Инструмент SUMA позволяет проецировать 2D-данные на 3D-карту коры головного мозга.
- “afni_proc.py” выполняет предварительную обработку данных МРТ, включая выравнивание по времени среза и коррекцию движений.
- Сглаживание и маска удаляют шум и не связанные с мозгом области с изображения.
- Масштабирование вокселей позволяет отображать изменения интенсивности в процентном соотношении.
-
Рекомендации и ссылки
- Ссылки на портал бесплатного ПО, NIMH и другие связанные темы.
Полный текст статьи: