Банк данных о белках
-
Обзор Банка белковых данных (PDB)
- PDB — база данных для трехмерных структур биологических молекул, контролируется wwPDB.
- Данные получают и хранят биологи и биохимики, используются методы рентгеновской кристаллографии, ЯМР-спектроскопии и криоэлектронной микроскопии.
- Все данные проверяются экспертами и доступны в Интернете под лицензией CC0 Public Domain.
-
Роль PDB в структурной биологии
- PDB важна для структурной геномики и требуется многими научными журналами и финансирующими агентствами.
- PDB используется другими базами данных для классификации и визуализации структур.
-
История и развитие PDB
- PDB создана объединением данных рентгеновской дифракции и молекулярной графики BRAD.
- Эдгар Мейер разработал программное обеспечение для хранения данных в едином формате.
- PDB была объявлена в 1971 году и с 1994 года является международной организацией.
-
Формат файла и просмотр данных
- PDB использует различные форматы файлов, включая PDB и mmCIF.
- Данные PDB можно просмотреть с помощью бесплатных и коммерческих программ визуализации.
-
Дополнительные ресурсы и рекомендации
- Ссылки на другие базы данных, программы для просмотра и документацию по PDB.