Оглавление
База данных генома Saccharomyces
-
Обзор базы данных генома Saccharomyces (SGD)
- SGD – это научная база данных, содержащая информацию о дрожжах Saccharomyces cerevisiae.
- Она предоставляет доступ к полной геномной последовательности, генам и их функциям, а также к литературе, подтверждающей данные.
- Результаты экспериментов интегрированы в базу данных и представлены в виде Locus Summary и мощного геномного браузера.
-
Интеграция и поиск информации
- Биоинформационные инструменты используются для интеграции и поиска новых биологических деталей.
- SGD предоставляет удобный интерфейс для отображения карт физических, генетических и последовательных признаков.
-
Сбор и аннотирование данных
- Биокураторы SGD собирают и аннотируют данные, используя структурированные знания в онтологии генов.
- Биохимические пути контролируются вручную и предоставляются с помощью Pathway Tools.
-
Номенклатура и стандарты
- SGD поддерживает уровень геномной номенклатуры и способствует соблюдению согласованных стандартов.
- При возникновении разногласий в названиях генов, SGD стремится к соглашению с сообществом.
-
Методы анализа
- SGD предлагает различные инструменты анализа, включая поиск по локальному выравниванию и рестрикционный анализ.
-
Рекомендации и использование
- Внешние ссылки и идентификатор генома Saccharomyces указаны для использования базы данных.