База данных геномов сахаромицетов

Оглавление1 База данных генома Saccharomyces1.1 Обзор базы данных генома Saccharomyces (SGD)1.2 Интеграция и поиск информации1.3 Сбор и аннотирование данных1.4 Номенклатура […]

База данных генома Saccharomyces

  • Обзор базы данных генома Saccharomyces (SGD)

    • SGD – это научная база данных, содержащая информацию о дрожжах Saccharomyces cerevisiae. 
    • Она предоставляет доступ к полной геномной последовательности, генам и их функциям, а также к литературе, подтверждающей данные. 
    • Результаты экспериментов интегрированы в базу данных и представлены в виде Locus Summary и мощного геномного браузера. 
  • Интеграция и поиск информации

    • Биоинформационные инструменты используются для интеграции и поиска новых биологических деталей. 
    • SGD предоставляет удобный интерфейс для отображения карт физических, генетических и последовательных признаков. 
  • Сбор и аннотирование данных

    • Биокураторы SGD собирают и аннотируют данные, используя структурированные знания в онтологии генов. 
    • Биохимические пути контролируются вручную и предоставляются с помощью Pathway Tools. 
  • Номенклатура и стандарты

    • SGD поддерживает уровень геномной номенклатуры и способствует соблюдению согласованных стандартов. 
    • При возникновении разногласий в названиях генов, SGD стремится к соглашению с сообществом. 
  • Методы анализа

    • SGD предлагает различные инструменты анализа, включая поиск по локальному выравниванию и рестрикционный анализ. 
  • Рекомендации и использование

    • Внешние ссылки и идентификатор генома Saccharomyces указаны для использования базы данных. 

Полный текст статьи:

База данных геномов сахаромицетов

Оставьте комментарий

Прокрутить вверх