Оглавление
Бифидобактерии
-
Классификация Bifidobacteriaceae
- Bifidobacteriaceae — единственное семейство бактерий в отряде Bifidobacteriales
- Отряд Bifidobacteriales является клайдом в подотряде Micrococcineae
- Род Bifidobacterium парафилетичен другим родам семейства
-
Филогенетическое древо
- В филогенетическом древе Gardnerella vaginalis разветвляется между видами бифидобактерий
- Род Bifidobacterium полифилетичен, но может быть монофилетическим при включении G. vaginalis
-
Геномика и молекулярные маркеры
- Обнаружены два сохраненных характерных признака, специфичных для отряда Bifidobacteriales
- Делеция в 1 аминокислоту в рибосомальном белке L13 характерна для всех видов Bifidobacteriales
- Вставка в глюкозо-6-фосфатдегидрогеназу характерна для Bifidobacterium и G. vaginalis
- Идентифицированы 16 консервативных сигнатурных белков, уникальных для отряда Bifidobacteriales
- Идентифицированы 6 консервативных сигнатурных белков, уникальных для Bifidobacterium и Gardnerella
-
Филогения и таксономия
- Принятая таксономия основана на LPSN
- Филогения основана на анализе всего генома