Привязка базы данных
-
Обзор базы данных BindingDB
- База данных содержит информацию о связывании белков с лигандами.
- Включает около 650 000 данных для 5700 белков и 280 000 молекул.
- Содержит данные о связывании «хозяин-гость» для химиков.
-
Цели и методы сбора данных
- Поддержка медицинской химии и разработки лекарств.
- Валидация методов вычислительной химии и молекулярного моделирования.
- Химическая биология и химическая геномика.
- Фундаментальные исследования в области физической химии и молекулярного распознавания.
-
История и финансирование
- Основана в середине 1990-х для сбора количественных данных о связывании.
- Финансирование от NSF и NIST для разработки базы данных.
- Не удалось полагаться на данные от экспериментаторов, поэтому проект сам занимается сбором данных из литературы.
-
Фокус на данных о связывании
- Сосредоточены на данных о связывании малых молекул с белками-мишенями с трехмерной структурой.
- Такой выбор способствует открытию лекарств и разработке методов вычислительного проектирования лигандов.
-
Веб-интерфейс и возможности
- Широкий спектр инструментов для просмотра, запроса и загрузки данных.
- Поиск по названию белка или цитированию в журнале.
- Запрос по химическому сходству и субструктуре.
- Загрузка данных по цели или результату запроса.
-
Дополнительная информация
- Учебная информация и документация доступны на BindingDB.org.
- Видеоуроки по основным задачам BindingDB больше не доступны.