Британский консорциум по геномике COVID-19
-
Создание и цели COG-UK
- Консорциум COVID-19 Genomics UK (COG-UK) создан в апреле 2020 года для сбора, секвенирования и анализа геномов SARS-CoV-2.
- Цель: мониторинг заноса SARS-CoV-2, передача инфекции, вспышки, оценка изменений в вирулентности и эффективности лечения.
-
Финансирование и структура
- Проект поддержан Министерством здравоохранения и социального обеспечения, UKRI и Институтом Веллкома Сэнгера.
- В ноябре 2020 года получено 12,2 млн фунтов стерлингов от Фонда инноваций в области тестирования.
- COG-UK включает четыре агентства общественного здравоохранения, Институт Веллкома Сэнгера и 16 академических партнеров.
-
Секвенирование и анализ данных
- Секвенирование проведено четырьмя агентствами общественного здравоохранения, Институтом Веллкома Сэнгера и 15 университетами.
- Данные привязаны к людям с помощью анонимного кода и загружены в CLIMB-COVID.
-
Влияние и результаты
- COG-UK секвенировала более 1,8 млн геномов SARS-CoV-2 к декабрю 2021 года.
- Данные использованы для выявления и мониторинга «вызывающих озабоченность» вариантов, отслеживания заноса и распространения COVID-19.
- Исследования COG-UK и других организаций внесли вклад в понимание биологии и эволюции вируса.
-
Стратегические области и обучение
- К сентябрю 2021 года COG-UK сосредоточилась на повышении ценности данных, продвижении исследований и координации учебной программы.
- Совместно с Wellcome Connecting Science запущена программа COG-Train для обучения использованию геномики.
-
Закрытие и наследие
- COG-UK официально закрылся в конце марта 2023 года.
- Проект оставил значительное наследие в области секвенирования и анализа геномов SARS-CoV-2.
-
COG-Train и Кембриджская независимая премия
- COG-Train получил высокую оценку в категории «Технологии во благо» на Кембриджской независимой премии 2024 года.
-
Разработка протоколов и инструментов
- Протоколы и инструменты COG-UK использовались во всем мире в первые три года пандемии COVID-19.
- Включают протоколы секвенирования, номенклатуру родословных SARS-CoV-2, биоинформатические инструменты и исследователь мутаций COG.
-
Достижения и события
- К декабрю 2020 года COG-UK загрузил в GISAID чуть менее 5% всех случаев заражения COVID-19 в Великобритании.
- К декабрю 2021 года в Великобритании было секвенировано более 1,8 миллиона геномов SARS-CoV-2.
- Проведены семинары и научные выставки для обмена достижениями и обсуждения.
-
Женщины в COG
- Организована серия интервью «Женщины в COG» о жизни и работе женщин в сети COG.
- Серия переработана в книгу «Снимки женщин в COG».
-
Наследие и публикации
- Члены COG-UK подготовили более 100 публикаций с апреля 2020 по март 2023 года.
- Независимая оценка Rand Europe показала значительный вклад COG-UK в понимание пандемии COVID-19 и геномный ландшафт общественного здравоохранения Великобритании.
-
История компании COG-UK
- История консорциума представлена на выставке «Борьба с Covid: история COG-UK».
- Доступ к выставке бесплатный через платформу «Что такое биотехнология».