Оглавление
Распознавание клеток
-
Описание платформы CellCognition
- CellCognition – это платформа с открытым исходным кодом для анализа изображений с помощью флуоресцентной микроскопии.
- Она используется для отслеживания и классификации клеток, измерения фаз клеточного цикла и составления карты фенотипа.
-
Особенности платформы
- CellCognition включает в себя методы обработки изображений, компьютерного зрения и машинного обучения.
- Она использует конвейер обработки изображений для сегментации, обнаружения объектов, извлечения признаков и классификации.
- Платформа также поддерживает отслеживание отдельных клеток и коррекцию ошибок классификации.
-
История и поддержка
- CellCognition была впервые выпущена в 2009 году и поддерживается лабораторией Герлиха.
- Последняя версия платформы – 1.6.1.
-
Применение и рекомендации
- Платформа использовалась в скрининге на основе RNAi и исследованиях клеточного цикла.
- Она также применяется для неконтролируемого моделирования.
-
Дополнительные ресурсы
- Ссылки на портал бесплатного программного обеспечения с открытым исходным кодом и официальный веб-сайт CellCognition.
- Платформа доступна на GitHub.
Полный текст статьи: