Длинный вкрапленный ядерный элемент
-
Описание LINEs
- LINEs (длинные вкрапленные ядерные элементы) — группа ретротранспозонов без LTR.
- Содержат внутренний промотор Pol II и кодируют белки ORF1 и ORF2.
- ORF2 необходим для ретротранспозиции и обладает обратной транскриптазной и эндонуклеазной активностью.
-
Распространение и классификация
- LINEs наиболее распространены в геноме человека, составляя около 20,7% последовательностей.
- Единственная активная линия у человека — LINE-1 (L1Hs).
- Линии делятся на шесть основных групп: R2, RanI, L1, RTE, I и Jockey.
-
Элементы L1
- LINE-1/L1 активен у всех териальных млекопитающих, кроме мегабатсов.
- В геноме человека L1 составляет около 516 000 копий.
- L1 также связан с некоторыми заболеваниями, такими как гемофилия А и рак.
-
Механизм размножения
- LINEs размножаются с помощью механизма обратной транскрипции с праймериз-мишенями (TPRT).
- ORF2 и ORF1 ассоциируются с мРНК, образуя рибонуклеопротеиновый комплекс.
- Комплекс транспортируется в ядро, где ORF2 открывает ДНК для обратной транскрипции.
-
Регулирование и связь с болезнями
- Клетки-хозяева регулируют активность L1 через эпигенетическое подавление.
- L1 связан с гемофилией А и другими заболеваниями, включая рак и неврологические расстройства.
- Гипометилирование L1 связано с хромосомной нестабильностью и измененной экспрессией генов.