Репарация с удалением нуклеотидов
-
Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER)
- Механизм восстановления ДНК
- Включает три пути: NER, BER и MMR
- NER особенно важен для устранения повреждений от УФ-излучения
-
Процесс NER
- Распознавание повреждения ДНК
- Удаление поврежденного сегмента
- Синтез комплементарной последовательности
- Завершение NER ДНК-лигазой
-
Подпроцессы NER
- Глобальный геномный NER (GG-NER)
- Связанный с транскрипцией NER (TC-NER)
-
Белки, участвующие в NER
- У эукариот: XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, ERCC1, RPA, RAD23A, RAD23B
- У прокариот: Uvr-белки
-
Заболевания, связанные с NER
- Пигментная ксеродермия
- Синдром Кокейна
-
Двойной разрез и восстановление
- Транскрипционный фактор II H (TFIIH)
- Репликационный белок A (RPA)
- Фактор репликации С (RFC)
-
Влияние на рак
- Генетические вариации в генах NER могут влиять на риск развития рака
- Полиморфизмы в генах NER связаны с риском рака легких
-
Дисфункция нервной системы
- Полиморфизмы в генах XPD и XPC могут влиять на нервную систему
-
Полиморфизмы и рак
- Полиморфизмы в экзоне 10 и экзоне 23 гена XPC связаны с риском развития рака.
- Полиморфизмы в интроне 9 и экзоне 15 гена XPC также коррелируют с риском рака.
- Двуаллельный полиморфизм в интроне 9 связан с повышенным риском рака кожи, молочной железы и простаты.
-
Влияние на прогноз рака
- Пигментная ксеродерма (XP) связана с дефицитом репарации ДНК, что увеличивает риск рака кожи в 1000 раз.
- У гетерозиготных пациентов риск рака спорадичен, но может быть предсказан на основе полиморфизмов генов репарации ДНК.
- Полиморфизм XPD (ERCC2) 2251A>C коррелирует с ранним рецидивом колоректального рака.
-
Старение и NER
- Мутации в генах NER вызывают признаки преждевременного старения у людей и мышей.
- Мутации в ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERCC6 и ERCC8 связаны с различными синдромами и преждевременным старением.
- Фибробласты мутантов демонстрируют дефектное восстановление ДНК, что может лежать в основе преждевременного старения.
-
Снижение NER с возрастом
- Исследования показывают снижение емкости NER с возрастом.
- Это снижение связано со снижением конститутивных уровней белков, участвующих в пути NER.