Европейский архив нуклеотидов

• История и развитие ENA

  • ENA – это глобальная база данных нуклеотидных последовательностей, созданная в 2008 году. 
  • ENA объединяет данные из различных источников, включая EMBL, GenBank и другие. 
  • ENA содержит полные геномы и данные о последовательностях для более чем 700 000 организмов. 

• Структура и содержание ENA

  • ENA состоит из трех основных разделов: EMBL-Bank, архив трассировок и архив считываний последовательностей (SRA). 
  • EMBL-Bank содержит высокоуровневые данные о сборке генома и аннотации. 
  • Архив трассировок включает данные о секвенировании и информацию о качестве. 
  • SRA принимает данные о последовательностях от различных платформ секвенирования и предоставляет доступ к анализам и выравниваниям. 

• Доступ и хранение данных

  • ENA предоставляет доступ к данным через REST API и браузер ENA. 
  • ENA сталкивается с проблемами хранения из-за экспоненциального роста данных. 
  • Для снижения требований к хранилищу используются инструменты сжатия, такие как CRAM. 

• Финансирование и будущее ENA

  • ENA финансируется Европейской лабораторией молекулярной биологии, Европейской комиссией и Wellcome Trust. 
  • Проект ELIXIR направлен на создание устойчивой финансовой инфраструктуры для поддержки баз данных по биологическим наукам.