Оглавление
Фармакофор
-
Определение фармакофора
- Фармакофор — это абстрактное описание молекулярных особенностей, необходимых для распознавания лиганда биологической макромолекулой.
- ИЮПАК определяет фармакофор как совокупность пространственных и электронных характеристик, обеспечивающих оптимальные супрамолекулярные взаимодействия.
-
Особенности фармакофоров
- Типичные свойства включают гидрофобные центроиды, ароматические кольца, акцепторы или доноры водородных связей, катионы и анионы.
- Эти признаки могут быть расположены на лиганде или в рецепторе.
- Взаимодействия лиганд-рецептор обычно полярно-положительные, полярно-отрицательные или гидрофобные.
-
Разработка модели фармакофора
- Процесс включает выбор обучающего набора лигандов, конформационный анализ, молекулярное наложение, абстракцию и валидацию.
- Модель фармакофора должна учитывать различия в биологической активности молекул.
-
Приложения фармакофоров
- В вычислительной химии фармакофоры используются для определения свойств молекул с одинаковой биологической активностью.
- Они помогают в разработке лекарств и 3D-моделей QSAR.
-
История фармакофора
- Современная идея фармакофора была популяризирована Лемонтом Киром в 1967 году.
- Ф. W. Шюлер использовал выражение “фармакофорная группа” в 1960-х годах.
- Паулю Эрлиху ошибочно приписывают разработку концепции, но он не использовал термин “фармакофор”.