Филогенетическое древо
- Филогенетическое древо – графическое представление эволюционной истории между видами или таксонами.
- Филогенетика – изучение филогенетических деревьев.
- Основная задача – найти оптимальное филогенетическое дерево, представляющее эволюционную родословную.
- Вычислительная филогенетика фокусируется на алгоритмах поиска оптимального филогенетического дерева.
- Филогенетические деревья могут быть укорененными или некорневыми, с помеченными или немаркированными листьями.
- Филогенетические деревья полезны в биоинформатике, систематике и филогенетике.
- Филогенетические деревья могут быть раздвоенными или многоветвистыми, помеченными или немаркированными.
- Существуют различные типы филогенетических деревьев: дендрограмма, кладограмма, филограмма, хронограмма, дальгренограмма, филогенетическая сеть, схема шпинделя, коралл жизни.
- Филогенетические деревья строятся с использованием методов вычислительной филогенетики, таких как методы матрицы расстояний и выравнивания последовательностей.
- Филогенетический анализ имеет ограничения, включая возможность фальсификации результатов и наличие помех в данных.
- Филогенетические деревья могут быть выведены на основе различных типов данных, включая морфологию, гены, события вставки и делеции.
Полный текст статьи: