Оглавление
- 1 Fitness landscape
- 1.1 Введение в эволюционную биологию
- 1.2 Фитнес-ландшафты
- 1.3 История и развитие
- 1.4 Типы фитнес-ландшафтов
- 1.5 Применение в эволюционной оптимизации
- 1.6 Ограничения и Caveats
- 1.7 Выводы
- 1.8 Pleiotropy Blog
- 1.9 Pup Fish Evolution
- 1.10 Evolution 101
- 1.11 Superimposing evolutionary trajectories onto fitness landscapes in virtual reality
- 1.12 Counterbalance: Evolution as movement through a fitness landscape
- 1.13 Полный текст статьи:
- 2 Фитнес-ландшафт
Fitness landscape
-
Введение в эволюционную биологию
- Эволюционная биология изучает происхождение и развитие жизни на Земле.
- Включает в себя множество дисциплин, таких как генетика, экология, палеонтология и другие.
-
Фитнес-ландшафты
- Визуализируют связь между генотипами и репродуктивным успехом.
- Каждый генотип имеет определенную репродуктивную способность (фитнес).
- Гентипы, близкие по fitness, считаются “близкими”, а далекие — “далекими”.
-
История и развитие
- Идея фитнес-ландшафтов была предложена Сьюэллом Райтом в 1932 году.
- В эволюционной оптимизации фитнес-ландшафты используются для оценки fitness функции.
-
Типы фитнес-ландшафтов
- Генетические: визуализируют связь между генотипами через мутации.
- Аллельные: описывают fitness как функцию аллельных частот.
- Фенотипические: представляют fitness как функцию фенотипических признаков.
-
Применение в эволюционной оптимизации
- Используются в генетических алгоритмах и эволюционных стратегиях.
- Позволяют решать задачи, где трудно проверить все возможные решения.
-
Ограничения и Caveats
- Человеческий разум не может мыслить в многомерных пространствах.
- Фитнес-ландшафты зависят от времени и окружающей среды.
- Ландшафты могут быть относительными, а не абсолютными.
-
Выводы
- Фитнес-ландшафты полезны для понимания эволюции.
- Можно измерять параметры ландшафта, такие как ruggedness и количество пиков.
- Экспериментально можно создавать и визуализировать фитнес-ландшафты эволюционных путей.
-
Pleiotropy Blog
- Обсуждение вклада Сергея Гаврилец
-
Pup Fish Evolution
- Исследование эволюции рыб в Калифорнийском университете в Дэвисе
-
Evolution 101
- Теория сдвигающего баланса
- Рисунок в нижней части страницы
-
Superimposing evolutionary trajectories onto fitness landscapes in virtual reality
- Исследование эволюции в виртуальной реальности
-
Counterbalance: Evolution as movement through a fitness landscape
- Обсуждение эволюции и фитнес-ландшафтов
- Интересная, но flawed дискуссия