Оглавление
Чембл
-
Описание базы данных ChEMBL
- ChEMBL – это база данных биоактивных молекул с лекарственными свойствами, поддерживаемая EBI и EMBL.
- Изначально известна как StARlite, разработана Inpharmatica Ltd., приобретена Galapagos NV.
- Данные получены в 2008 году от Wellcome Trust, что привело к созданию группы хемогеномики.
-
Применение и доступ
- Содержит информацию о биологической активности соединений относительно лекарств-мишеней.
- Включает индексы Ki, Kd, IC50, EC50, данные могут быть отфильтрованы и проанализированы.
- В 2010 году выпущена версия 2 с 2,4 миллионами результатов, в 2010 – версия 8 с 2,97 миллионами измерений.
- В ChEMBL_10 добавлены PubChem подтверждения, интегрированные данные сопоставимы с chembl8.
- Доступ через веб-интерфейс или загрузку по протоколу передачи файлов, отформатирован для компьютерного анализа.
-
Интеграция и связанные ресурсы
- ChEMBL интегрирован с PubChem и системой ChemSpider, а также разработаны инструменты для интеллектуального анализа данных.
- GPCR SARfari и Kinase SARfari – программное обеспечение для хемогеномики, ChEMBL-NTD – хранилище данных о скрининге для тропических болезней.
- В июле 2012 года выпущена новая служба сбора данных о малярии, в октябре 2013 – myChEMBL, виртуальная машина для доступа к инфраструктуре химинформатики.
- В декабре 2013 года SureChem по патентной информатике перенесен в EMBL-EBI и переименован в SureChEMBL.
- В 2014 году представлен ADME SARfari для прогнозирования и сравнения целевых показателей ADME.
-
Дополнительные ресурсы
- Ссылки на ChEMBL: Краткий онлайн-тур на поезде EBI, Чеби, Банк лекарств, рекомендации, внешние ссылки.
- Идентификатор ChEMBL (P592) и архив ChEMBL-NTD доступны через Wayback Machine.