Картирование архитектуры генома
-
Основы анализа генома
- Анализ генома включает в себя изучение структуры и функций генов.
- Геном состоит из множества генов, которые расположены в определенных локусах.
- Локусы могут быть связаны друг с другом, что влияет на их экспрессию.
-
Методы анализа генома
- Методы анализа генома включают в себя секвенирование следующего поколения и картирование генома.
- Секвенирование позволяет определить последовательность ДНК, а картирование помогает определить расположение генов.
-
Расчет вероятности взаимодействия локусов
- Вероятность взаимодействия локусов зависит от их расположения и взаимодействия.
- Для расчета вероятности взаимодействия используются математические модели.
-
Оценка состояния взаимодействия локусов
- Состояние взаимодействия локусов может быть оценено с помощью статистических методов.
- Вероятность взаимодействия может быть рассчитана для различных состояний локусов.
-
Статистический анализ срезов
- Срезы генома используются для анализа взаимодействия локусов.
- Статистический анализ срезов позволяет оценить вероятность взаимодействия пар локусов.
-
Эффективность обнаружения
- Эффективность обнаружения влияет на точность результатов анализа генома.
- Учет эффективности обнаружения позволяет улучшить результаты расчета.
-
Совместное разделение и нормализованная связь
- Совместное разделение и нормализованная связь используются для анализа геномных окон и связей между ними.
- Эти методы позволяют определить неравновесие по сцеплению и реальную связь между геномными окнами.
-
Расчет связей и частот
- Расчет связей и частот включает в себя определение частоты обнаружения и нормализованной связи для каждого геномного окна.
- Полученные значения используются для создания матрицы и отображения связей между окнами.
- Пересказана только часть статьи. Для продолжения перейдите к чтению оригинала.