Оглавление
БОЧОНОК
-
Обзор базы данных KEGG
- KEGG – это коллекция баз данных, связанных с геномами, биологическими путями, болезнями, лекарствами и химическими веществами.
- Используется для исследований и образования в биоинформатике, включая анализ данных о геномах и метагеномах.
- Проект KEGG был инициирован в 1995 году Минору Канехисой и связан с японской программой “Геном человека”.
-
Структура и содержание KEGG
- KEGG состоит из карт путей, модулей, баз данных о геномах, генах, болезнях, лекарствах и окружающей среде.
- Карты путей представляют метаболические и клеточные процессы, а модули – функциональные единицы генов.
- KEGG включает базы данных о химических соединениях, ферментах и реакциях, а также о болезнях и лекарствах.
-
Использование и устойчивость
- KEGG предоставляет доступ к информации через веб-сайт и FTP-загрузку, но с 2011 года внедрила модель подписки из-за сокращения государственного финансирования.
- Несмотря на модель подписки, KEGG остается в свободном доступе на своем веб-сайте.
-
Дополнительные ресурсы
- Упоминаются другие базы данных, связанные с KEGG, такие как CTD, ConsensusPathDB и GO.
- Ссылки на веб-сайт KEGG, зеркальный сайт GenomeNet и запись в MetaBase для KEGG.