Оглавление
Минимальный информационный стандарт
-
Определение и цель минимальных информационных стандартов
- Минимальные информационные стандарты – это набор руководящих принципов для представления данных, полученных высокопроизводительными методами.
- Стандарты облегчают проверку, анализ и интерпретацию данных научным сообществом.
- Они способствуют передаче данных из журнальных статей в базы данных для анализа.
-
Типы экспериментов и стандарты
- Стандарты разработаны для различных типов экспериментов, включая микрочипы, RNAseq, метаболомику и протеомику.
- Они включают требования к отчетности и форматы данных, адаптированные к конкретным методам.
-
Разработка и согласование стандартов
- Стандарты разрабатываются междисциплинарными специалистами и согласовываются в рамках проекта MIBBI.
- Они охватывают различные области, включая фенотипирование растений, количественные эксперименты по ПЦР в реальном времени и другие.
-
Примеры стандартов
- MIAME – это стандарт для микрочипов, который обеспечивает однозначную интерпретацию результатов и облегчает распространение данных.
- MINI – это стандарт для электрофизиологических исследований, который облегчает доступ к данным и их анализ.
- MIARE – это стандарт для экспериментов с RNAi, который обеспечивает однозначную интерпретацию результатов.
- MIACA – это стандарт для клеточного анализа, который облегчает обмен данными и их анализ.
- MIAAPE – это стандарт для протеомных экспериментов, который описывает минимальную информацию, необходимую для экспериментов.
- Другие стандарты включают MIFlowCyt, MIFlowCyt, MIRIAM и другие, которые охватывают различные области исследований.
-
Интеграция и обмен данными
- MIBBI служит “единым окном” для изучения и развития различных проектов, способствуя их интеграции.
- Каталог биообмена предоставляет внешние ссылки на стандарты и инициативы в области биоинформатики.
Полный текст статьи: