Оглавление
Молекулярная филогенетика
-
Основы молекулярной систематики
- Молекулярная систематика использует молекулярные данные для классификации организмов.
- Ранние попытки использовали белки, ферменты и углеводы, но теперь предпочтение отдается секвенированию ДНК.
- Секвенирование ДНК позволяет точно определить последовательности нуклеотидов.
-
Методы молекулярной систематики
- Секвенирование определенного участка хромосомы позволяет определить гаплотипы.
- Гаплотипы сравниваются для выявления различий между организмами.
- Статистический кластерный анализ и методы бутстрэпинга и jackknifing используются для оценки положения гаплотипов в эволюционных деревьях.
-
Применение молекулярной филогении
- Молекулярная филогения используется для построения “дерева взаимоотношений” между организмами.
- Секвенирование по Сэнгеру и высокопроизводительное секвенирование применяются для идентификации молекулярных структур.
- Молекулярно-филогенетический анализ включает в себя множество этапов, включая получение последовательности действий, выравнивание последовательностей и построение филогенетического дерева.
-
Ограничения молекулярной систематики
- Молекулярная систематика основана на кладистическом подходе и предполагает монофилетические таксоны.
- Горизонтальный перенос генов усложняет классификацию, а разные модели могут давать разные результаты.
- Метод построения дерева чувствителен к предположениям и моделям, а также к выборке таксонов.