Оглавление
Полимеразный
-
Определение и функции полимераз
- Полимераза – фермент, синтезирующий длинные цепочки полимеров или нуклеиновых кислот
- ДНК-полимераза и РНК-полимераза используются для сборки ДНК и РНК соответственно
- ДНК-полимераза из Thermus aquaticus используется в полимеразной цепной реакции
-
Типы полимераз
- Полимеразы могут быть шаблон-зависимыми или шаблон-независимыми
- Поли-А-полимераза не зависит от матрицы
- Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза обладает матрикс-независимой и матрикс-зависимой активностями
-
Семейства полимераз
- Семейство А: ДНК-полимераза I, Pol γ, θ, ν
- Семейство В: ДНК-полимераза II, Pol α, δ, ε, ζ
- Семейство С: голофермент ДНК-полимеразы III
- Семейство Y: ДНК-полимераза IV, ДНК-полимераза V, SOS-полимеразы репарации
- Теломераза
- Мультисубъединица: РНК-полимераза I, РНК-полимераза II, РНК-полимераза III
- Одно-субъединичный: РНК-полимераза T7, POLRMT
- Примаза, ПримПол
- Вирусный: одно-субъединичный
- Эукариотическая клетка: cRdRP, двойная субъединица
- Полиаденилирование: PAP, PNP-аза
-
Структура полимераз
- Полимеразы подразделяются на “правосторонние” и “бета-бочкообразные”
- “Правосторонние” обнаружены почти во всех ДНК-полимеразах и вирусных односубъединичных полимеразах
- “Бета-бочкообразные” наблюдаются во всех многосубъединичных РНК-полимеразах, cRdRP и ДНК-полимеразах архей
- Семейство “X” представлено ДНК-полимеразой бета, имеет неопределенную форму ладони
- Приматы не попадают ни в одну из этих категорий
-
Бактериальные праймазы
- Бактериальные праймазы имеют домен Toprim и связаны с топоизомеразами и митохондриальной геликазой twinkle
- Архейные и эукариотические праймазы образуют семейство AEP, возможно, родственное полимеразе palm
- Оба семейства ассоциируются с одним и тем же набором геликаз