Последовательность нуклеиновых кислот
-
Последовательность нуклеиновых кислот
- Последовательность оснований внутри нуклеотидов
- Обозначается серией из пяти букв
- Последовательность обычно представлена от 5′ до 3′ конца
- Для ДНК существует два направления: смысловая и антисмысловая цепи
-
Нуклеотиды и их структура
- Нуклеиновые кислоты состоят из нуклеотидов
- Нуклеотиды состоят из фосфатной группы, сахара и нуклеинового основания
- Возможные основания: A, C, G, T, U
- Нуклеиновые основания играют роль в спаривании и формировании структур
-
Обозначение и двусмысленность
- Буквы A, T, C, G обозначают конкретные нуклеотиды
- W означает, что могут встречаться аденин или тимин
- Модифицированные основания: m5C, псевдоуридин, дигидроуридин, инозин, риботимидин, m7G
-
Биологическое значение
- Нуклеиновые кислоты содержат информацию для построения белков
- Каждая группа из трех оснований (кодон) соответствует одной аминокислоте
- Центральная догма молекулярной биологии описывает механизм построения белков
-
Определение последовательности
- Секвенирование ДНК определяет нуклеотидную последовательность
- Последовательность ДНК важна для выживания и размножения организмов
- Современные методы секвенирования основаны на различающей способности ДНК-полимераз
-
Цифровое представление и анализ
- Последовательности сохраняются в цифровом формате
- Цифровые последовательности могут анализироваться и использоваться для создания новой ДНК
-
Генетическое тестирование
- ДНК анализируется для диагностики наследственных заболеваний
- Генетическое тестирование выявляет изменения в хромосомах, генах или белках
- Используется несколько сотен генетических тестов
-
Выравнивание последовательностей
- Выравнивание последовательностей выявляет области сходства
- Несоответствия интерпретируются как мутации
- Высокая идентичность последовательностей указывает на молодого общего предка
-
Гипотеза молекулярных часов
- Предполагает постоянную скорость эволюционных изменений
- Не учитывает различия в скорости репарации ДНК и функциональном сохранении участков последовательности
- Не учитывает разницу в степени приемлемости мутаций
-
Последовательность мотивов
- Первичная структура кодирует функциональные мотивы
- Примеры мотивов: C/D, H/ACA, сайт связывания Sm, последовательность Шайна-Дальгарно, последовательность консенсуса Козака, терминатор РНК-полимеразы III
-
Энтропия последовательности
- Количественная мера локальной сложности последовательности ДНК
- Позволяет анализировать последовательности без выравнивания
- Используется для обнаружения мотивов и перестановок
-
Дополнительные ресурсы
- Структура гена
- Определение структуры нуклеиновых кислот
- Четвертичная система счисления
- Однонуклеотидный полиморфизм (SNP)
- Рекомендации
- Внешние ссылки
- Библиография по особенностям, закономерностям, корреляциям в текстах о ДНК и белках