Оглавление

Проект создания базы данных генома ансамбля

История и цели проекта Ensembl
- Проект Ensembl запущен в 1999 году для автоматического аннотирования генома человека.
- Цель проекта – сделать геномные данные доступными для мирового исследовательского сообщества.
Процесс аннотирования и хранения данных
- Данные о последовательностях передаются в систему аннотаций генов, которая создает предсказанные местоположения генов.
- Данные сохраняются в базе данных MySQL для последующего анализа и отображения.
Расширение проекта
- Проект расширился, включив дополнительные виды и геномные данные.
- В 2009 году проект Ensembl Genomes расширил охват на многоклеточных беспозвоночных, растения, грибы, бактерии и простейших.
Отображение геномных данных
- Ensembl предоставляет графические представления о расположении генов и других геномных данных.
- Интерфейс позволяет настраивать отображение и увеличивать масштаб.
- Данные могут быть экспортированы в различные форматы файлов.
Альтернативные методы доступа
- Ensembl предоставляет REST API и Perl API для доступа к данным.
- API используется для написания скриптов и доступа к базе данных MySQL.
- Пользователи могут использовать biomaRt для загрузки больших наборов данных.
Текущие виды и открытый исходный код
- Аннотированные геномы включают наиболее полно секвенированные позвоночные и модельные организмы.
- Все данные и программное обеспечение с открытым исходным кодом доступны по лицензии CC BY 4.0.
- Веб-сайт базы данных Ensembl зеркально отображен в четырех местах для улучшения сервиса.

Полный текст статьи:

Проект базы данных генома Ensembl

Проект базы данных генома Ensembl

Проект создания базы данных генома ансамбля

История и цели проекта Ensembl

Процесс аннотирования и хранения данных

Расширение проекта

Отображение геномных данных

Альтернативные методы доступа

Текущие виды и открытый исходный код

Полный текст статьи:

Проект базы данных генома Ensembl

Похожие статьи:

Оставьте комментарий Отменить ответ