Профилировщик клеток
-
Обзор CellProfiler
- CellProfiler — это бесплатное программное обеспечение для биологов, которое автоматизирует количественный анализ изображений.
- Алгоритмы анализа изображений доступны в виде модулей, которые могут быть объединены в конвейер для идентификации и измерения биологических объектов.
- CellProfiler поддерживает различные форматы микроскопических изображений и позволяет биологам измерять морфологию, интенсивность и текстуру клеток.
- Программа взаимодействует с различными научными библиотеками для выполнения математических операций и чтения изображений.
-
История и развитие
- CellProfiler был выпущен в 2005 году и с тех пор был значительно улучшен.
- Версия 2.0 была переписана на Python в 2010 году, а версия 3.0 добавила поддержку 3D-анализа и глубокого обучения в 2017 году.
- Версия 4.0, выпущенная в 2020 году, улучшила скорость, удобство использования и перешла на Python 3.
-
Сообщество и поддержка
- CellProfiler является проектом с открытым исходным кодом, что позволяет пользователям разрабатывать собственные модули и вносить свой вклад в проект.
- На официальном веб-сайте есть форум для обсуждения и получения ответов на вопросы от создателей проекта.
-
Рекомендации
- Ссылки на официальный веб-сайт и портал бесплатного программного обеспечения с открытым исходным кодом предоставлены для дополнительной информации.
Полный текст статьи: