Просвечивающая электронная криомикроскопия
-
Просвечивающая электронная криомикроскопия (CryoTEM)
- Разновидность криогенной электронной микроскопии
- Исследует образцы при криогенных температурах
- Популярна в структурной биологии
-
Преимущества CryoTEM
- Наблюдение образцов без окрашивания или фиксации
- Демонстрация образцов в естественной среде
- Разрешение, близкое к атомарному
-
Развитие CryoTEM
- Первоначально использовалась для борьбы с радиационным повреждением
- В 1984 году Жак Дюбоше продемонстрировал изображения аденовируса
- В 2012 году внедрены прямые электронные детекторы и улучшены алгоритмы
-
Биологические образцы
- Тонкая пленка: образцы замораживаются в жидком этане
- Срезы стекловидного тела: образцы остекловываются и нарезаются алмазным ножом
- Образцы материалов: криотема используется для летучих материалов
-
Обработка изображений
- Вероятностные подходы: максимальное правдоподобие и байесовский подход
- Максимальное правдоподобие: итеративный процесс, зависит от первоначального предположения
- Байесовский подход: эмпирический, сглаживает карты, уменьшает шум
-
Автоматизация криовоздействия и реконструкции изображений
- Появление новых методов криовоздействия и реконструкции изображений
- Разработка программных решений для автоматизации процесса
-
RELION: эмпирический байесовский подход
- Программа RELION (REgularized LIkelihood OptimizatioN) для 3D-реконструкции
- Широкое распространение в области крио-ТЭМ
- Улучшение разрешения реконструированных изображений
- Универсальные скрипты на языке python
- Классификация 2D/3D моделей и создание новых моделей
-
Методы криотеме
- Анализ двумерных кристаллов
- Анализ спиральных нитей или трубок
- Дифракция электронов на микрокристаллах (MicroED)
- Криотема с временным разрешением
- Электронная криотомография (cryoET)
-
Дополнительные ресурсы
- Криогенная сканирующая электронная микроскопия
- Банк данных EM
- Разрешение (электронная плотность)
- Анализ одиночных частиц
-
Рекомендации
- Дальнейшее чтение
- Внешние ссылки
- Ресурсы в вашей библиотеке
- Ресурсы в других библиотеках
-
Примеры исследований
- Тонкая структура замороженного вируса
- Сложная одночастичная электронная криомикроскопия
- Начало обучения на онлайн-курсе Cryo–EM от Калифорнийского технологического института