Рибопереключатель

От / / Оставьте комментарий

Оглавление1 Рибовыключатель1.1 Определение и функции рибопереключателей1.2 История и открытия1.3 Механизмы действия1.4 Типы рибопереключателей1.5 Рибопереключатели TPP1.6 Рибопереключатели ZMP/ZTP1.7 Предполагаемые рибопереключатели1.8 Кандидаты […]

'Рибопереключатель', 'РНК', 'Цис-регуляторные элементы РНК', Cis-regulatory RNA elements, Riboswitch, RNA

Рибовыключатель

  • Определение и функции рибопереключателей

    • Рибопереключатели связывают небольшие молекулы, изменяя выработку белков.  
    • мРНК с рибопереключателем регулирует свою активность в зависимости от концентрации эффекторной молекулы.  

  • История и открытия

    • Рибопереключатели были открыты в 2002 году.  
    • Первые доказательства существования рибопереключателей включали анализы беспротеинового связывания.  
    • Рибопереключатели признаны новым механизмом регуляции генов.  

  • Механизмы действия

    • Рибопереключатели делятся на аптамер и платформу экспрессии.  
    • Аптамер связывает молекулу, платформа экспрессии регулирует экспрессию генов.  
    • Рибопереключатели могут отключать или включать экспрессию генов.  

  • Типы рибопереключателей

    • Рибопереключатель кобаламина регулирует биосинтез и транспорт кобаламина.  
    • Циклические рибопереключатели di-GMP регулируют множество генов.  
    • Фторидные рибопереключатели помогают выдерживать высокие уровни фтора.  
    • Рибопереключатель FMN регулирует биосинтез и транспорт рибофлавина.  
    • glmS расщепляется при наличии глюкозамин-6-фосфата.  
    • Глютаминовые рибопереключатели регулируют метаболизм глютамина и азота.  
    • Рибопереключатель глицина регулирует метаболизм глицина.  
    • Лизиновый рибопереключатель регулирует биосинтез, катаболизм и транспорт лизина.  
    • Марганец и никель-кобальтовые рибопереключатели связывают ионы металлов.  
    • Рибопереключатели PreQ1 регулируют синтез и транспортировку пре-квеозина.  
    • Пуриновые рибопереключатели регулируют метаболизм и транспортировку пуринов.  
    • Рибопереключатели SAH регулируют утилизацию S-аденозилгомоцистеина.  
    • Рибопереключатели SAM регулируют биосинтез и транспорт метионина и SAM.  
    • Тетрагидрофолатные рибопереключатели регулируют синтез и транспорт генов.  

  • Рибопереключатели TPP

    • Связывают пирофосфат тиамина (TPP)  
    • Регулируют биосинтез и транспорт тиамина  
    • Единственный рибопереключатель у эукариот  

  • Рибопереключатели ZMP/ZTP

    • Распознают ZMP и ZTP  
    • Регулируют метаболизм пуринов de novo  

  • Предполагаемые рибопереключатели

    • Мотив Моко-РНК связывает кофактор молибдена  
    • Регулируют гены, участвующие в биосинтезе и транспортировке молибдена  

  • Кандидаты на рибопереключатели

    • РНК-мотив CrCb, manA, pfl, ydaO/yuaA, yjdF, ykkC-yxkD, yybP-ykoY  
    • Функции неизвестны  

  • Вычислительные модели

    • Искатели генов-рибопереключателей: Infernal, RibEx, RiboSW  
    • Предикторы конформационного переключения: paRNAss, RNAshapes, RNAbor  
    • Инструмент SwiSpot охватывает обе группы  

  • Гипотеза о мире РНК

    • Рибопереключатели связывают небольшие молекулы  
    • Подтверждают гипотезу о мире РНК  
    • Некоторые рибопереключатели могут быть древними регуляторными системами  

  • Рибопереключатели как мишени для антибиотиков

    • Некоторые антибиотики воздействуют на рибопереключатели  
    • Пиритиаминпирофосфат активирует рибопереключатель TPP, убивая клетку  

  • Сконструированные рибопереключатели

    • Интерес к разработке искусственных рибопереключателей  
    • Применение в промышленности и медицине, например, генная терапия  

  • РНК-термометр

    • Регуляторные сегменты мРНК, меняющие конформацию в ответ на температуру  

Полный текст статьи:

Рибопереключатель

Похожие статьи:

  1. История биологии РНК Оглавление1 История биологии РНК1.1 История исследований РНК1.2 Различия между РНК и ДНК1.3 Локализация и роль РНК1.4...
  2. РНК Оглавление1 РНК1.1 Структура и функции РНК1.2 Различия между ДНК и РНК1.3 Вторичные и третичные структуры РНК1.4...
  3. Мир РНК Оглавление1 Мир РНК1.1 Мир РНК: гипотеза и история1.2 Свойства РНК1.3 Эволюция и стабильность1.4 Альтернативные гипотезы1.5 РНК...
  4. Регуляция экспрессии генов Оглавление1 Регуляция экспрессии генов1.1 Регуляция экспрессии генов1.2 Этапы экспрессии генов1.3 Структурный уровень регуляции1.4 Химический уровень регуляции1.5...
  5. Джин Оглавление1 Ген1.1 Определение гена1.2 Экспрессия гена1.3 Мутации и аллели1.4 История термина “ген”1.5 Эволюция и популяционная генетика1.6...
  6. Некодирующая РНК Оглавление1 Некодирующая РНК1.1 Определение и классификация некодирующих РНК1.2 История и открытия1.3 Биологические роли1.4 Регуляция генов1.5 Действующий...
  7. Балтиморская классификация Оглавление1 Балтиморская классификация1.1 Балтиморская классификация вирусов1.2 Группы вирусов1.3 ДНК-вирусы1.4 РНК-вирусы1.5 Классификация РНК-вирусов1.6 Группа III: двухцепочечные РНК-вирусы1.7...
  8. Балтиморская классификация Оглавление1 Балтиморская классификация1.1 Балтиморская классификация вирусов1.2 Группы вирусов1.3 ДНК-вирусы1.4 РНК-вирусы1.5 Классификация РНК-вирусов1.6 Группа III: двухцепочечные РНК-вирусы1.7...
  9. микроРНК – Википедия Оглавление1 микроРНК1.1 Микрорибонуклеиновые кислоты (микроРНК)1.2 Функции микроРНК1.3 Эволюция и консервативность1.4 История открытия1.5 Номенклатура микроРНК1.6 Цели микроРНК1.7...
  10. Транскрипция (биология) – Википедия Оглавление1 Транскрипция (биология)1.1 Транскрипция1.2 Регуляция транскрипции1.3 Основные шаги транскрипции1.4 Метилирование и деметилирование1.5 Факторы транскрипции1.6 Активация транскрипции...
  11. РНК-вирус Оглавление1 RNA virus1.1 Классификация и характеристики1.2 Классификация по полярности РНК1.3 Двухцепочечные РНК вирусы1.4 Мутации и сложность...
  12. Тиамин – Arc.Ask3.Ru Оглавление1 Тиамин1.1 Определение и структура тиамина1.2 Пищевые источники и дефицит1.3 Биологические функции1.4 Медицинское применение1.5 Диетические рекомендации1.6...
  13. микроРНК – Arc.Ask3.Ru Оглавление1 микроРНК1.1 Микрорибонуклеиновые кислоты (микроРНК)1.2 Функции микроРНК1.3 Эволюция и консервативность1.4 История открытия1.5 Номенклатура микроРНК1.6 Цели микроРНК1.7...
  14. Метаболизм Оглавление1 Метаболизм1.1 Метаболизм и его функции1.2 Классификация метаболических реакций1.3 Ферменты и их роль1.4 Основные биохимические вещества1.5...
  15. РНК Оглавление1 РНК1.1 История и структура РНК1.2 Функции РНК1.3 РНК-вирусы и обратная транскрипция1.4 Открытие и исследования РНК1.5...
  16. Биосинтез Оглавление1 Биосинтез1.1 Биосинтез аминокислот1.2 Синтез предшественников1.3 Конденсация1.4 Трансаминирование1.5 Биосинтез глутамата и глутамина1.6 Биосинтез аргинина1.7 Биосинтез лизина1.8...
  17. Рибозим Оглавление1 Рибозим1.1 Открытие рибозимов1.2 Структура и механизм1.3 Примеры и функции1.4 Происхождение жизни1.5 Открытие рибозимов1.6 Эволюция рибозимов1.7...
  18. Трансфекция Оглавление1 Трансфекция1.1 Определение трансфекции1.2 Эволюция термина1.3 Методы трансфекции1.4 Стабильная и кратковременная трансфекция1.5 Трансфекция РНК1.6 Ограничения метода...
  19. Рибозим Оглавление1 Рибозим1.1 Открытие рибозимов1.2 Структура и механизм1.3 Функции и применение1.4 Происхождение жизни1.5 Открытие рибозимов1.6 Эволюция рибозимов1.7...
  20. Доставка генов Оглавление1 Доставка генов1.1 История и методы доставки генов1.2 Методы доставки генов1.3 Вирусная доставка генов1.4 Приложения1.5 Методы...
  21. Рибонуклеаза Оглавление1 Рибонуклеаза1.1 Рибонуклеазы: определение и классификация1.2 Функции РНКаз1.3 Защита РНК от РНКаз1.4 Классификация эндорибонуклеаз1.5 Классификация экзорибонуклеаз1.6...
  22. Cas9 Оглавление1 Cas91.1 Cas9: основная функция и применение1.2 Механизм работы CRISPR-Cas91.3 Использование в генной инженерии1.4 Иммунитет, опосредованный...

Оставьте комментарий

Прокрутить вверх