Вариант омикрона SARS-CoV-2
-
Происхождение и классификация Омикрона
- Омикрон (B.1.1.529) был впервые обнаружен в Ботсване и Южной Африке в ноябре 2021 года.
- ВОЗ объявила его вызывающим обеспокоенность вариантом 26 ноября 2021 года.
- Омикрон имеет несколько подвариантов, включая BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 и BA.5.
- С октября 2022 года появились подварианты BQ.1 и BQ.1.1.
- В сентябре 2024 года появился новый субвариант XEC.
-
Распространение и мутации
- Омикрон быстро распространился по всему миру, став преобладающим вариантом.
- В ноябре 2021 года первые случаи за пределами Африки были зафиксированы в Гонконге и Бельгии.
- В декабре 2021 года случаи были выявлены в Израиле, Германии, Великобритании, Нидерландах, Австралии, Дании, Австрии, Чехии и Канаде.
- В январе 2022 года Омикрон был подтвержден в 149 странах.
-
Гипотезы происхождения
- Омикрон не развился из другого варианта, а пошел своим путем.
- Рассматриваются гипотезы о мутациях от другого коронавируса или связи с ВИЧ-инфекцией.
- Одна из гипотез предполагает, что SARS-CoV-2 был передан от человека мышам и мутировал в их популяции.
-
Влияние на здоровье и вакцинацию
- Три дозы вакцины обеспечивают защиту от тяжелых заболеваний и госпитализации.
- У вакцинированных лиц варианты ВА.4 и ВА.5 более заразны, но нет свидетельств большей заболеваемости или тяжести заболевания.
-
Классификация и распространение
- Омикрон классифицируется как COVID-19 и SARS-CoV-2.
- Случаи Омикрона зафиксированы в различных странах, включая Африку, Азию, Европу, Северную Америку, Океанию и Южную Америку.
- Омикрон распространился через круизные лайнеры и военно-морские корабли.
-
Распространение Омикрона
- Омикрон был обнаружен в Южной Африке и начал распространяться по миру.
- Первые случаи заражения были зарегистрированы в Португалии, Швеции, Испании, Нидерландах, Японии, Израиле, Бразилии, Германии, Нигерии, США, Ирландии, Южной Корее, Малайзии, Намибии, Фиджи и Великобритании.
- В декабре 2021 года Омикрон стал доминирующим штаммом в США и других странах.
-
Реакция производителей вакцин
- BioNTech, AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson и другие компании изучают влияние Омикрона на эффективность своих вакцин.
- Novavax разрабатывает обновленную вакцину, требующую двух доз.
- Институт Гамалеи и Sinovac также разрабатывают вакцины против Омикрона.
-
Рекомендации ВОЗ
- ВОЗ рекомендовала странам усилить эпиднадзор и секвенирование.
- ВОЗ рекомендовала не вводить новые ограничения на поездки, а применять «основанный на риске и научный» подход.
- ВОЗ предупредила о высоком глобальном риске и необходимости ускорить вакцинацию и укрепить системы здравоохранения.
-
Международная реакция
- Несколько стран ввели запреты на поездки из Южной Африки.
- Бразилия рекомендовала ввести ограничения на полеты.
- Швейцария ввела обязательные тесты и карантин для прибывающих из стран с Омикроном.
- Южная Африка выступила против запретов на поездки, утверждая, что они противоречат нормам ВОЗ.
-
Экономические и социальные последствия
- Запреты на поездки могут оказать значительное влияние на экономику Южной Африки.
- Низкий охват вакцинацией в менее развитых странах создает возможности для появления новых вариантов.
- ВОЗ призвала к заключению нового соглашения о борьбе с пандемиями.
-
Подготовка к Omicron в США
- Президент Байден заявил, что Omicron вызывает беспокойство, но не панику.
- Введены масштабные карантинные меры, подобные тем, что были в 2020 году.
-
Меры в Канаде и других странах
- В Канаде восстановлены ограничения на собрания и ужесточены требования к вакцинации.
- В Британской Колумбии запрещены мероприятия без сидячих мест.
- В Квебеке введен частичный карантин.
- В Нидерландах объявлен карантин на праздничный период.
-
Сокращение интервала между дозами вакцины
- В Великобритании, Южной Корее и Таиланде интервал сокращен до трех месяцев.
- В Бельгии, Франции, Сингапуре, Тайване, Италии и Австралии — до пяти месяцев.
- Финляндия сократила интервал до трех месяцев для групп риска.
-
Биология Omicron
- Omicron имеет около 50 мутаций, большинство из которых в белке spike.
- Существует несколько подвариантов, включая BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 и BA.5.
- BA.2 вызывает менее тяжелое заболевание, чем BA.1.
-
Распространение Omicron
- BA.2 обнаружен в 40 странах, включая Индию, Филиппины, Скандинавию и Южную Африку.
- В Дании BA.2 стал доминирующим в январе 2022 года.
- В США BA.2 стал доминирующим в марте 2022 года.
-
Новые подварианты
- В Великобритании выделен рекомбинант BA.1-BA.2, названный XE.
- В Нью-Йорке обнаружены подварианты BA.2.12 и BA.2.12.1.
- В Индии обнаружен BA.2.75, классифицированный ВОЗ как вариант под мониторингом.
- В августе 2022 года обнаружен XBB, рекомбинант сублиний BA.2.10.1.1 и BA.2.75.3.1.1.1.
- В марте 2023 года в Индии обнаружен XBB.1.16, вызвавший всплеск госпитализаций.
- В феврале 2023 года обнаружен EG.5, названный «Эрис», который стал причиной каждого седьмого нового случая заболевания в Великобритании.
- В июле 2023 года обнаружен HV.1, обогнавший EG.5 в качестве доминирующего подварианта в США.
-
Подварианты BA.4 и BA.5
- BA.4 обнаружен в Южной Африке, Ботсване, Дании, Шотландии и Англии
- BA.5 доминировал в Португалии, Великобритании, Германии и США
- BA.5.2.1 зарегистрирован в Калифорнии и Шанхае
- BA.5.2.1 вытеснил BA.2.12.1 в Онтарио
- BA.5.2.1 доминирует в Австралии, Бельгии, Брунее, Греции и Исландии
-
Подварианты BQ.1 и BQ.1.1
- Обнаружены в октябре 2022 года
- Первоначально распространены во Франции
- В ноябре 2022 года в США на эти варианты приходится 44% новых случаев
- Лучше переносят первую и бустерную вакцины
-
Подварианты 2024 года
- KP.2 и KP.1.1 доминируют в США
- KP.3 зарегистрирован в Новом Южном Уэльсе
- KP.3 может более эффективно связываться с клетками человека
-
Заразность и иммунитет
- Омикрон заразнее кори
- Время удвоения заболеваемости в Великобритании менее двух дней
- Омикрон снижает иммунитет от предшествующей инфекции и вакцин
- Омикрон способствует естественному иммунитету к повторному заражению
-
Эффективность вакцин
- Вакцины Pfizer-BioNTech и Moderna снижают риск серьезных заболеваний
- Четвертая доза частично эффективна против Омикрона
- Эффективность вакцин против Омикрона ниже, чем против других вариантов
- Повторная доза необходима для снижения смертности
-
Подварианты BA.1 и BA.2
- Вакцины обеспечивают сходный уровень защиты от симптоматических заболеваний
- Требуется дальнейшая повторная вакцинация из-за ослабления эффекта вакцин
-
Подварианты BA.4 и BA.5
- Могут вызывать повторные инфекции COVID-19
- Ослабление иммунитета при ВА.4 и ВА.5 умеренное по сравнению с ВА.1
- Иммунитет от омикронной инфекции слабый против не-омикронных вариантов
-
Подварианты BQ.1 и BQ.1.1
- Лучше переносят первую и бустерную вакцинацию
- Снижают эффективность лечения моноклональными антителами
-
Разработка и одобрение вакцин
- Pfizer и Moderna разработали двухвалентные вакцины для защиты от дикого типа SARS-CoV-2 и варианта Omicron.
- В сентябре 2022 года FDA разрешило использование двухвалентных вакцин.
- В июне 2023 года FDA рекомендовало обновить рецептуру вакцин для использования в США.
- В октябре 2024 года EMA одобрило обновление состава Бимервакса.
-
Симптомы и вирулентность
- Потеря вкуса и запаха не является обычным явлением для Omicron.
- Единственным зарегистрированным симптомом Omicron является ночная потливость.
- Omicron размножается в бронхах быстрее, чем Delta, но менее опасен.
- В Южной Калифорнии случаи инфицирования Omicron на 91% менее смертельны, чем Delta.
-
Диагностика и ПЦР-тестирование
- Вероятность выявления Omicron зависит от уровня секвенирования.
- В январе 2022 года TGA протестировало экспресс-тесты на антиген COVID-19 для выявления Omicron.
- В декабре 2021 года FDA рекомендовало использовать тесты, выявляющие множественные генные мишени.
-
Различия между BA.1 и BA.2
- BA.2 не имеет характерного сбоя в работе мишени S-гена, что затрудняет его выявление.
- Некоторые страны используют тесты, выявляющие несколько мутаций, включая L452R.
-
Лечение
- Кортикостероиды и блокаторы рецепторов IL6 эффективны для лечения тяжелой формы COVID-19.
- Моноклональные антитела сохраняют нейтрализующую активность против ключевых мутаций Omicron.
- Большинство моноклональных антител утратили активность против Omicron in vitro.
-
Эпидемиология
- В ноябре 2021 года в Южной Африке Omicron стал доминирующим вариантом.
- Omicron часто инфицирует людей, ранее инфицированных COVID-19.
- Omicron имеет явное преимущество в росте в Южной Африке.
-
Рост случаев заражения Омикроном в Великобритании
- Логарифмический показатель увеличения числа случаев составил 0,37 в день
- К 14 декабря Омикрон стал наиболее распространенным штаммом
- Прогнозируется, что к 24 декабря число заражений достигнет миллиона в день
-
Рост случаев заражения Омикроном в других странах
- В Дании темпы роста были примерно такими же, период удвоения 2-3 дня
- В Швейцарии Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 1 января
- В Германии Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 1 января
- В Шотландии Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 17 декабря
- В Канаде Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 13 декабря
- В США Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 18 декабря
- В Португалии число случаев заражения Омикроном достигло 61,5% 22 декабря
- В Бельгии Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 25 декабря
- В Нидерландах Омикрон стал наиболее распространенным штаммом 28 декабря
- В Италии 20 декабря заболеваемость COVID-19 достигла 28% и удваивалась каждые два дня
- В Норвегии Омикрон стал доминирующим вариантом 25 декабря
- Во Франции Омикрон составлял около 15% случаев COVID-19 в декабре, но к 27 декабря их число возросло более чем до 60%
-
Рекомендации по тестированию
- Исследователи рекомендуют взять пробы у 5% пациентов с COVID-19 для выявления Омикрона или других вариантов
-
Рост штамма BA.2
- В Дании штамм BA.2 рос на ~0,10% в день и стал доминирующим на второй неделе 2022 года
- В Великобритании штамм BA.2 прирост составлял ~0,11% в день
-
Различия в уровне госпитализации
- Уровень госпитализации в США и Канаде выше, чем в Европе и Южной Африке
- Это связано с большим числом пожилых людей, большей распространенностью сопутствующих заболеваний, более высокой передачей инфекции в помещениях, более низким уровнем вакцинации в США и, возможно, высокой распространенностью Дельта-вируса