Оглавление
- 1 Сеть мирового сообщества
- 1.1 История и развитие
- 1.2 Цели и задачи
- 1.3 Масштаб и операции
- 1.4 Проблемы и решения
- 1.5 Статистика и конкуренция
- 1.6 Пропаганда и научные результаты
- 1.7 Проекты по борьбе с туберкулезом
- 1.8 Проекты по борьбе с лихорадкой Денге
- 1.9 Проекты по чистой энергии
- 1.10 Проекты по борьбе со СПИДом
- 1.11 Проекты по поиску лекарств от лейшманиоза
- 1.12 Проекты по вычислениям для чистой воды
- 1.13 Проекты по борьбе с шистосомой
- 1.14 Проекты по борьбе с ВИЧ
- 1.15 Активные подпроекты
- 1.16 Завершенные подпроекты
- 1.17 Помощь в лечении мышечной дистрофии
- 1.18 Открываем лекарства от лихорадки Денге
- 1.19 Африканский климат@Home
- 1.20 Помогите победить рак
- 1.21 Питательный рис для всего мира
- 1.22 Проект “Чистая энергетика”
- 1.23 Помогите бороться с детским раком
- 1.24 Поиск противовирусных препаратов против гриппа
- 1.25 Совместное открытие лекарств от лихорадки Денге
- 1.26 Вычисления для получения чистой воды
- 1.27 Поиск лекарств от лейшманиоза
- 1.28 Поиск лекарств от лейшманиоза
- 1.29 Проект “ВПЕРЕД, борьба с малярией”
- 1.30 Проект “Скажи “нет” шистосоме”
- 1.31 Вычисления для устойчивого использования водных ресурсов
- 1.32 Раскрытие тайн генома
- 1.33 Вместе перехитрим Эболу
- 1.34 ОпенЗика
- 1.35 Боевые помощники@Home
- 1.36 Боевые помощники@Домашняя фаза 2
- 1.37 Проект по укреплению иммунитета к микробиому
- 1.38 Полный текст статьи:
- 2 Сетка мирового сообщества
Сеть мирового сообщества
-
История и развитие
- World Community Grid (WCG) запущен 16 ноября 2004 года.
- Первоначально использовал клиент Grid MP, затем перешел на BOINC в 2008 году.
- В 2021 году IBM передала право собственности Исследовательскому институту Крембил.
-
Цели и задачи
- WCG использует неиспользуемые вычислительные мощности для научных исследований.
- Проекты включают анализ генома человека, ВИЧ, лихорадки денге и других заболеваний.
- В настоящее время существует пять активных и 26 завершенных проектов.
-
Масштаб и операции
- Более 23 000 активных учетных записей и 57 000 активных устройств.
- Выполнено более 6 000 000 000 рабочих единиц.
- Программное обеспечение использует неиспользуемое время устройств для расчетов.
-
Проблемы и решения
- Увеличение нагрузки на процессоры может привести к перегреву.
- BOINC использует ограничения для предотвращения перегрузки.
- TThrottle помогает решить проблему перегрева.
-
Статистика и конкуренция
- Вклад пользователей регистрируется и доступен.
- Баллы начисляются за обработку рабочих модулей.
- Пользователи могут присоединяться к командам для соревнования.
-
Пропаганда и научные результаты
- WCG признает партнеров и делает результаты вычислений доступными.
- Проекты включают открытие новых соединений для лечения рака и малярии.
- GFAM выполнил миллиард различных расчетов стыковки.
-
Проекты по борьбе с туберкулезом
- Синтезированы аналоги “хитов” против лекарственно-устойчивого штамма туберкулеза
- Отсутствие финансирования помешало дальнейшему изучению данных
-
Проекты по борьбе с лихорадкой Денге
- Открыты новые ингибиторы протеазы Денге и вируса Западного Нила
- Разработан препарат, отключающий ключевой фермент вируса денге
- Препарат не имеет негативных побочных эффектов
-
Проекты по чистой энергии
- Опубликована база данных с более чем 2,3 миллионами органических молекул
- 35 000 молекул показали потенциал удвоения эффективности солнечных элементов
-
Проекты по борьбе со СПИДом
- Обнаружены соединения, присоединяющиеся к вирусу в новых местах связывания
- Соединения могут усилить существующие методы лечения и замедлить развитие лекарственной устойчивости
-
Проекты по поиску лекарств от лейшманиоза
- Протестированы 10 лучших соединений, 4 показали положительные результаты in vitro
- В августе 2017 года тестирование in vivo показало положительные результаты
- В марте 2018 года ни одно из 10 соединений не показало достаточной противолейшманиозной активности
-
Проекты по вычислениям для чистой воды
- Описан новый тип фильтра для воды на основе нанотрубок
- Моделирование на WCG показало увеличение потока воды через нанотрубки на 300%
-
Проекты по борьбе с шистосомой
- Определены три наиболее перспективных вещества-кандидата для тестирования in vitro
-
Проекты по борьбе с ВИЧ
- Определено новое межсубъединичное взаимодействие, критичное для сборки ядра ВИЧ-1
- Использовано более 1,6 миллиона соединений для определения 20 конформаций кармана
-
Активные подпроекты
- Открытая пандемия – COVID-19: выявление методов лечения коронавируса 2-го типа
- Отображение раковых маркеров: выявление маркеров различных типов рака
- Помогите остановить туберкулез: моделирование поведения миколевых кислот
- Победить детский рак: поиск лекарств-кандидатов для лечения рака у детей
- Проект по дождеванию в Африке: улучшение моделирования осадков для фермеров в Африке
-
Завершенные подпроекты
- Свертывание протеома человека – Фаза 1: предсказание структуры белков человека
- Свертывание протеома человека – Фаза 2: модели белков с более высоким разрешением
- Помогите победить рак: выявление визуальных закономерностей в тканевых микрочипах
- Сравнение генома: сравнение последовательностей генов различных организмов
-
Помощь в лечении мышечной дистрофии
- Фаза 1: исследование межбелковых взаимодействий для 40 000 белков, завершение в 2007 году
- Фаза 2: исследование межбелковых взаимодействий для более чем 2200 белков, завершение в 2012 году
-
Открываем лекарства от лихорадки Денге
- Фаза 1: тестирование противовирусных препаратов против вирусов семейства flaviviridae, завершение в 2009 году
- Фаза 2: отбор кандидатов для лабораторных испытаний
-
Африканский климат@Home
- Разработка климатических моделей для Африки, завершение в 2008 году
-
Помогите победить рак
- Улучшение результатов рентгеновской кристаллографии белков, завершение в 2013 году
-
Питательный рис для всего мира
- Предсказание структуры белков риса для улучшения урожайности и устойчивости к болезням, завершение в 2010 году
-
Проект “Чистая энергетика”
- Поиск новых материалов для солнечных батарей и устройств хранения энергии, завершение в 2009 и 2010 годах
-
Помогите бороться с детским раком
- Поиск лекарств для отключения белков, связанных с нейробластомой, завершение в 2009 году
-
Поиск противовирусных препаратов против гриппа
- Поиск новых лекарств для остановки распространения гриппозной инфекции, завершение в 2009 году
-
Совместное открытие лекарств от лихорадки Денге
- Выявление перспективных лекарственных препаратов для борьбы с лихорадкой Денге и другими вирусами, завершение в 2010 году
-
Вычисления для получения чистой воды
- Изучение молекулярного происхождения эффективного потока воды, завершение в 2014 году
-
Поиск лекарств от лейшманиоза
-
Поиск лекарств от лейшманиоза
- Университет Антиокии и Техасский университет в Галвестоне
- Использование World Community Grid для компьютерного моделирования
- Цель: выявление молекул-кандидатов для лечения лейшманиоза
-
Проект “ВПЕРЕД, борьба с малярией”
- Миссия: поиск перспективных лекарственных препаратов для малярии
- Тестирование соединений в Исследовательском институте Скриппса
-
Проект “Скажи “нет” шистосоме”
- Исследователи из университетов Инфориум и ФИОКРУС-Минас
- Компьютерное моделирование для поиска методов лечения шистосомоза
- Определение трех перспективных веществ-кандидатов для тестирования in vitro
-
Вычисления для устойчивого использования водных ресурсов
- Университет Вирджинии
- Изучение влияния деятельности человека на водораздел
- Завершение проекта 17 октября 2012 года
-
Раскрытие тайн генома
- Совместное сотрудничество австралийских и бразильских ученых
- Изучение около 200 миллионов генов для выяснения их функции
- Влияние на медицину и экологические исследования
-
Вместе перехитрим Эболу
- Исследовательский институт Скриппса
- Поиск химических соединений для борьбы с вирусом Эбола
- Блокировка важнейших этапов жизненного цикла вируса
- Завершение проекта 6 декабря 2018 года
-
ОпенЗика
- Борьба с вирусом Зика
- Изучение белков, используемых вирусом Зика
- Завершение проекта 13 декабря 2019 года
-
Боевые помощники@Home
- Первый проект World Community Grid, направленный на борьбу с одним заболеванием
- Проверка взаимодействия молекул с протеазой ВИЧ
- Публикация первой научной статьи в 2007 году
-
Боевые помощники@Домашняя фаза 2
- Более подробное рассмотрение результатов фазы 1
- Проверка корректности архитектуры моделирования и эффективности BEDAM и AutoDock
-
Проект по укреплению иммунитета к микробиому
- Исследование белков бактерий в организме человека
- Изучение микробиома человека для определения его функций
- Сотрудничество с Калифорнийским университетом в Сан-Диего и другими учреждениями