Стоп-кодон
-
Стоп-кодоны в молекулярной биологии
- Стоп-кодоны сигнализируют о завершении трансляции белка.
- Большинство кодонов добавляют аминокислоты, стоп-кодоны прекращают процесс.
- Стоп-кодоны связываются с факторами высвобождения, что приводит к диссоциации рибосомы.
-
Свойства стоп-кодонов
- Стандартные кодоны: UAA, UAG, UGA.
- Альтернативные стоп-кодоны обнаружены в митохондриальных геномах и у некоторых организмов.
- Переназначенные стоп-кодоны существуют в различных генетических кодах.
-
Перевод и распределение стоп-кодонов
- Селеноцистеин инкорпорируется котрансляционно, кодон UGA управляет его включением.
- У прокариот и эукариот разные механизмы переопределения терминирующей функции UGA.
- Распределение стоп-кодонов коррелирует с содержанием GC в геноме.
-
Распознавание стоп-кодонов
- У бактерий распознавание связано с трипептидным антикодоном.
- Гипотеза о трипептидном антикодоне не подтверждена.
-
Номенклатура стоп-кодонов
- Стоп-кодоны названы по мутантам, обнаруженным в бактериофагах.
- Янтарные мутации (UAG) и мутации цвета охры (UAA) соответствуют триплетам UAG и UAA.
- Мутации опала (UGA) названы по минералу опалу.
-
Мутации и болезни
- Бессмысленные мутации приводят к укорочению белка.
- Безостановочные мутации удаляют стоп-кодон, вызывая непрерывную трансляцию.
- Непрерывные мутации связаны с наследственными заболеваниями.
-
Скрытые остановки и стоп-сигналы
- Скрытые остановки прекращают трансляцию при сдвиге кадра.
- Соотношение стоп-сигналов в геномах бактерий сходно, несмотря на различия в содержании генов.
-
Подавление стоп-кодонов
- Стоп-кодоны могут считываться как смысловые кодоны.
- Трансляционное считывание распространено у вирусов и бактерий.
- Степень считывания у млекопитающих варьирует и влияет на протеом.
-
Использование стоп-кодонов
- Стоп-кодоны используются для создания водяных знаков в РНК и ДНК.
-
Создание синтетической клетки
- В 2010 году Крейг Вентер представил первую полностью функционирующую клетку, управляемую синтетической ДНК
- Команда Вентера использовала частые стоп-кодоны для создания водяных знаков в РНК и ДНК
-
Подтверждение синтетичности
- Стоп-кодоны использовались для подтверждения, что результаты были синтетическими, а не контаминированными
- Стоп-кодоны кодировали имена авторов и адреса веб-сайтов
-
Генетический код
- Генетический код состоит из трех нуклеотидов, называемых кодонами
- Каждый кодон имеет определенное значение, определяемое его нуклеотидным составом
-
Стартовый кодон
- Стартовый кодон определяет начало генетического кода
- Он состоит из одного нуклеотида и определяет, какой кодон будет следующим
-
Терминатор (генетика)
- Терминатор завершает генетический код
- Он состоит из одного нуклеотида и определяет, будет ли следующий кодон
-
Строка, заканчивающаяся нулем
- Строка, заканчивающаяся нулем, используется для обозначения конца генетического кода
- Она состоит из нуклеотидов и нуклеотидных остатков