Тест на нуклеиновые кислоты
-
Тест на нуклеиновые кислоты (NAT)
- Метод определения последовательности нуклеиновых кислот
- Обнаружение и идентификация вирусов и бактерий
- Отличие от других тестов: выявление генетического материала, а не антигенов или антител
-
Методы амплификации нуклеиновых кислот (NAATs)
- Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
- Анализ смещения цепей (SDA)
- Анализ, опосредованный транскрипцией (TMA)
- Изотермическая амплификация, опосредованная петлей (LAMP)
-
Специфичность спаривания оснований
- Молекулы одноцепочечного зонда захватывают молекулы-мишени ДНК или РНК
- Конструкция нитей зондов важна для чувствительности и специфичности
-
Проблемы специфичности
- Мутанты могут отличаться одним основанием, что приводит к ложноположительным результатам
- Исследования направлены на достижение специфичности для одной базы
-
Достижения в специфичности
- Зонд для обмена опорами (PC) оптимизирует специфичность гибридизации
- Зонды для обмена пальцами работают при различных температурах и концентрациях
- Флуоресцентные молекулярные зонды позволяют оптически определять мишени
-
Конкурентные композиции
- Высокая селективность однонуклеотидных вариантов (SNV)
- Модель кинетической реакции для прогнозирования оптимальных параметров
- Применение для анализа последовательностей с низким содержанием VAF
-
Амплификация с блокирующим вытеснением (BDA)
- Высокотемпературная ПЦР для избирательного амплифицирования вариантов
- Обнаружение и количественное определение редких вариантов ДНК
- Подтверждение на клинических образцах ДНК
-
Приложения
- Диагностика гонококковой и других нейссериановых инфекций
- Диагностика урогенитального рака и инфекций, вызванных трахоматозом
- Выявление микобактерий туберкулеза
- Обнаружение РНК или ДНК ВИЧ
- Выявление зоонозных коронавирусов
- Диагностический тест на SARS-CoV-2
- Выявление устойчивых к антибиотикам бактерий после лечения антибиотиками