Топологический индекс

• Определение и применение топологических индексов

  • Топологические индексы используются для описания молекулярной топологии и являются графически инвариантными. 
  • Они применяются в QSAR для корреляции структуры молекул с их биологической активностью. 

• Расчет топологических индексов

  • Индексы основаны на молекулярных графах с подавленным содержанием водорода. 
  • Матрицы расстояния или смежности используются для получения инварианта графа. 
  • Топологические индексы могут быть вычислены на основе молекулярных графиков без учета энергии структуры. 

• Типы топологических индексов

  • Простейшие индексы не учитывают двойные связи и типы атомов. 
  • Более сложные индексы учитывают состояние гибридизации атомов. 
  • Примеры индексов включают индекс Хосоя, индекс Винера и J-индекс Балабана. 

• Глобальные и локальные индексы

  • Индекс Хосоя и индекс Винера являются глобальными индексами. 
  • Бончев и Полански предложили локальные индексы для каждого атома в молекуле. 

• Способность к различению и супериндексы

  • Топологические индексы могут иметь одинаковое значение для множества молекулярных графов. 
  • Объединение нескольких индексов может повысить способность к различению. 

• Вычислительная сложность

  • Некоторые индексы, такие как индекс Винера, имеют быстрые алгоритмы расчета. 
  • Индекс Хосоя и его модификации требуют экспоненциальных алгоритмов. 

• Список топологических индексов

  • В статье перечислены различные топологические индексы, включая индекс Хосоя и индекс Винера. 

• Применение в QSAR

  • QSAR используются для прогнозирования биологической активности молекул на основе их структуры. 
  • Индексы ETA были использованы для разработки прогностических моделей QSAR. 

• Рекомендации и ссылки

  • Статья предлагает дальнейшее чтение и ссылки на программное обеспечение для расчета топологических индексов.