Оглавление
- 1 Топологический индекс
- 1.1 Определение и применение топологических индексов
- 1.2 Расчет топологических индексов
- 1.3 Типы топологических индексов
- 1.4 Глобальные и локальные индексы
- 1.5 Способность к различению и супериндексы
- 1.6 Вычислительная сложность
- 1.7 Список топологических индексов
- 1.8 Применение в QSAR
- 1.9 Рекомендации и ссылки
- 2 Топологический индекс — Википедия
Топологический индекс
-
Определение и применение топологических индексов
- Топологические индексы используются для описания молекулярной топологии и являются графически инвариантными.
- Они применяются в QSAR для корреляции структуры молекул с их биологической активностью.
-
Расчет топологических индексов
- Индексы основаны на молекулярных графах с подавленным содержанием водорода.
- Матрицы расстояния или смежности используются для получения инварианта графа.
- Топологические индексы могут быть вычислены на основе молекулярных графиков без учета энергии структуры.
-
Типы топологических индексов
- Простейшие индексы не учитывают двойные связи и типы атомов.
- Более сложные индексы учитывают состояние гибридизации атомов.
- Примеры индексов включают индекс Хосоя, индекс Винера и J-индекс Балабана.
-
Глобальные и локальные индексы
- Индекс Хосоя и индекс Винера являются глобальными индексами.
- Бончев и Полански предложили локальные индексы для каждого атома в молекуле.
-
Способность к различению и супериндексы
- Топологические индексы могут иметь одинаковое значение для множества молекулярных графов.
- Объединение нескольких индексов может повысить способность к различению.
-
Вычислительная сложность
- Некоторые индексы, такие как индекс Винера, имеют быстрые алгоритмы расчета.
- Индекс Хосоя и его модификации требуют экспоненциальных алгоритмов.
-
Список топологических индексов
- В статье перечислены различные топологические индексы, включая индекс Хосоя и индекс Винера.
-
Применение в QSAR
- QSAR используются для прогнозирования биологической активности молекул на основе их структуры.
- Индексы ETA были использованы для разработки прогностических моделей QSAR.
-
Рекомендации и ссылки
- Статья предлагает дальнейшее чтение и ссылки на программное обеспечение для расчета топологических индексов.
Полный текст статьи: