Транспозиция
-
Транспозаза и транспозиция
- Транспозаза — фермент, связывающийся с концом транспозона и перемещающий его в другую часть генома.
- Транспозоны были открыты Барбарой Макклинток в 1940-х годах.
- Транспозиция важна для генетического разнообразия и приспособляемости.
-
Транспозаза Tn5
- Tn5 — транспозаза, кодирующая устойчивость к антибиотикам.
- Tn5 неактивна из-за подавления N- и С-концов.
- Мутация L372P делает Tn5 гиперактивной.
- Tn5 использует механизм вырезания и вставки.
-
Механизм транспозиции Tn5
- Связывание Tnp, синапсис, расщепление, захват мишени и перенос нити.
- Ионы магния активируют кислород, создавая заколку.
- Транспозаза перемещает транспозон в подходящее место.
-
Изучение Tn5
- Tn5 используется в секвенировании генома и ATAC-seq.
- Недостатки включают меньший контроль размера фрагментов и склонность к высокому содержанию G-C.
-
Транспозаза «Спящая красавица»
- Транспозаза SB управляет системой транспозонов «Спящая красавица».
- Используется у позвоночных для переноса генов и генной терапии.
-
Транспозон Tn7
- Транспозон Tn7 кодирует устойчивость к антибиотикам.
- Имеет два механизма распространения: конъюгируемые плазмиды и attTn7.
- Tn7 кодирует пять белков, включая TnsAB, TnsC и TnsD.
- TnsAB удаляет и вставляет транспозон, TnsC стимулирует процессы.
-
Активация транспозазы TnsC
- TnsC активирует транспозазу через взаимодействие с ДНК-мишенью и белками TnsD или TnsE
- TnsD и TnsE являются альтернативными селекторами мишеней и активаторами связывания с ДНК
-
Роль белков TnsA, TnsB и TnsC
- TnsA и TnsB образуют транспозазу
- TnsC регулирует активность транспозазы, связываясь с TnsD и TnsE
-
Взаимодействие TnsE и TnsABC
- TnsE направляет вставки в конъюгируемые плазмиды
- TnsD направляет вставки в высококонсервативный участок бактериальной хромосомы attTn7
-
Рекомендации и внешние ссылки
- Ссылки на статьи и разделы медицинской тематики Национальной медицинской библиотеки (MeSH)
- Обзор структурной информации для транспозазы Tn5 в PDBe-KB