Оглавление
UniProt (УниПрот)
-
История и развитие UniProt
- UniProt – это консорциум, созданный в 1995 году для координации усилий по созданию базы данных белковых последовательностей.
- В 2002 году EBI, SIB и PIR объединились в консорциум UniProt.
-
Корневые файлы баз данных UniProt
- Каждый член консорциума активно участвует в ведении базы данных по белкам и составлении аннотаций.
- До недавнего времени EBI и SIB совместно создавали базы данных Swiss-Prot и Trembl’, а PIR – базу данных о белковых последовательностях (PIR-PSD)).
-
Организация баз данных UniProt
- UniProt предоставляет четыре основные базы данных: UniProtKB, UniParc, UniRef и Proteome.
- UniProtKB – это база данных о белках с аннотациями вручную и без избыточности.
- UniParc – это архив UniProt, содержащий все белковые последовательности из основных баз данных без избыточности.
- UniRef – это база данных кластеризованных наборов белковых последовательностей, которые группируются с использованием алгоритма CD-HIT.
-
Финансирование и рекомендации
- UniProt финансируется за счет грантов различных организаций.
- В статье также есть раздел с внешними ссылками и идентификационным номером белка UniProt (P352).