Оценщик Уоттерсона
-
Основы оценки Уоттерсона
- Оценка Уоттерсона используется для описания генетического разнообразия в популяциях.
- Разработана Маргарет Ву и Дж. А. Уоттерсоном в 1970-х годах.
- Оценивается путем подсчета полиморфных сайтов, отражает частоту мутаций.
-
Предположения и формула
- Предполагается выборка из популяции, бесконечное количество мутирующих участков и n ≪ Ne.
- Используется поправочный коэффициент an для учета увеличения количества сегрегирующих сайтов с увеличением количества последовательностей.
- Формула для оценки θ^w учитывает количество сегрегирующих сайтов и размер выборки.
-
Свойства оценки
- Оценка Уоттерсона является несмещенной при выполнении предположений.
- Дисперсия оценки уменьшается с увеличением размера выборки или скорости рекомбинации.
- Может быть искажена при экспоненциально растущем населении или нарушении мутационной модели.
-
Применение и сравнение
- Используется для сравнения разнообразия нуклеотидов с критерием Таджимы для оценки эволюционного режима локуса.
-
Дополнительная информация
- Ссылки на другие статьи и формулы для отбора проб Ивенса приведены в конце статьи.
Полный текст статьи: