Формат FASTA

• Обзор формата FASTA

  • Формат FASTA используется для представления последовательностей ДНК и РНК. 
  • Последовательность начинается с символа “>”, за которым следует описание. 
  • Описание может содержать уникальный идентификатор и дополнительную информацию. 

• История и эволюция

  • Формат FASTA был разработан в 1980-х годах для представления последовательностей в компьютерных базах данных. 
  • В начале использовались однострочные описания, но позже были введены многострочные описания. 
  • В 1990-х годах формат был стандартизирован и стал широко использоваться в биоинформатике. 

• Структура файла FASTA

  • Файл FASTA состоит из последовательностей, описаний и комментариев. 
  • Последовательности могут быть представлены в виде чередующихся или последовательных строк. 
  • Идентификаторы NCBI используются для однозначной идентификации последовательностей. 

• Расширения и сжатие

  • Нет стандартного расширения имени файла для FASTA. 
  • Для сжатия файлов FASTA используются специальные компрессоры. 
  • Шифрование файлов FASTA возможно с помощью различных инструментов. 

• Работа с файлами FASTA

  • Доступны скрипты и онлайн-инструменты для работы с файлами FASTA. 
  • Существуют онлайн-конвертеры форматов для преобразования файлов FASTA. 

• Рекомендации и внешние ссылки

  • Ссылки на полезные ресурсы и инструменты для работы с файлами FASTA предоставлены в статье.