Формат FASTA
-
Обзор формата FASTA
- Формат FASTA используется для представления последовательностей ДНК и РНК.
- Последовательность начинается с символа «>», за которым следует описание.
- Описание может содержать уникальный идентификатор и дополнительную информацию.
-
История и эволюция
- Формат FASTA был разработан в 1980-х годах для представления последовательностей в компьютерных базах данных.
- В начале использовались однострочные описания, но позже были введены многострочные описания.
- В 1990-х годах формат был стандартизирован и стал широко использоваться в биоинформатике.
-
Структура файла FASTA
- Файл FASTA состоит из последовательностей, описаний и комментариев.
- Последовательности могут быть представлены в виде чередующихся или последовательных строк.
- Идентификаторы NCBI используются для однозначной идентификации последовательностей.
-
Расширения и сжатие
- Нет стандартного расширения имени файла для FASTA.
- Для сжатия файлов FASTA используются специальные компрессоры.
- Шифрование файлов FASTA возможно с помощью различных инструментов.
-
Работа с файлами FASTA
- Доступны скрипты и онлайн-инструменты для работы с файлами FASTA.
- Существуют онлайн-конвертеры форматов для преобразования файлов FASTA.
-
Рекомендации и внешние ссылки
- Ссылки на полезные ресурсы и инструменты для работы с файлами FASTA предоставлены в статье.