Свернутая спираль
-
Спиральная спираль
- Структурный мотив в белках, состоящий из 2-7 альфа-спиралей
- Содержится в 5-10% белков, выполняет множество функций
- Участвует в межбелковых взаимодействиях
-
История открытия
- Лайнус Полинг и Фрэнсис Крик независимо пришли к выводу о существовании спиральных спиралей
- Полинг опубликовал рукопись в Nature, Крик отправил заметку позже
- Лаборатория Крика объявила, что идея пришла к обоим независимо
-
Молекулярная структура
- Спирали содержат повторяющийся гептадный повтор
- Гидрофобные остатки образуют амфипатическую структуру
- Упаковка спиралей плотная, с ван-дер-Ваальсовым контактом
-
Биологические роли
- Облегчают взаимодействие белок-белок
- Участвуют в слиянии мембран, разделении молекул, перемещении везикул
- Примеры: ВИЧ, SNAP-25, синаптобревин, синтаксин-1
-
Молекулярные распорки
- Разделяют белковые домены и везикулы
- Примеры: Omp-α, p115, гигантин, GM130
-
В качестве меток олигомеризации
- Используются для стабилизации или усиления олигомеризации
- Примеры: BBSome, BBS2, BBS7
-
Дизайн
- Спиральные спирали хорошо изучены для определения олигомерного состояния
- Харбери и др. установили правила для GCN4
- Размещение полярных остатков обеспечивает параллельную сборку
-
Биомедицинские приложения
- Спиральные мотивы используются в наноструктурах
- Примеры: визуализирующие агенты, биомедицинские приложения
-
Применение спиральных доменов
- Доставка лекарств: спиральные домены помогают избежать попадания лекарств в здоровые ткани.
- Регенерация тканей: спиральные домены могут связываться с белками или маркерами клеточной поверхности.
- Хранение и транспортировка лекарств: создание нанотрубок и других структур для хранения и транспортировки лекарств.
- Вакцины: спиральные домены усиливают отображение антигена, повышая эффективность вакцин.
-
Олигомеризация и белковые оригами
- Олигомеризация спиральных мотивов позволяет создавать белковые оригами и строительные блоки.
- Изучены взаимодействия металл-лиганд, ковалентные связи и ионные взаимодействия.
- Созданы самосборяющиеся наноструктуры из спиральных мотивов.
-
Трудности и применение
- Остаются трудности со стабильностью.
- Пептиды со спиральными мотивами упрощают создание трехмерных структур для культивирования клеток.
- Применение в изучении тканей, тканевой инженерии и других областях.
-
Программное обеспечение и базы данных
- Spiricoil предсказывает свернутое спиралью и олигомерное состояние на основе белковых последовательностей.
- NCOILS и bCIPA оценивают значения Tm для пар намотанных катушек.
- STRAP и PrOCoil предсказывают олигомеризацию белков.
- DrawCoil создает спиральные диаграммы для намотанных рулонов.
- Spiricoil использует аннотацию к белковому домену для предсказания наличия свернутых спиралей.
- CC + Архивировано 2011-11-08 в the Wayback Machine — реляционная база данных о намотанных катушках.