Оглавление
Полипролиновая спираль
-
Полипролиновая спираль II (PPII)
- Левосторонняя спираль с двугранными углами (-75°, 150°) и транс-изомерными пептидными связями
- Угол поворота Ω = -120°, три остатка на виток, увеличение на остаток 3,1 Å
- Связывается доменами SH3, важна для межбелковых взаимодействий
- Не имеет внутренних водородных связей, атомы амидного азота и кислорода расположены неправильно
- Часто наблюдается в белках, даже для аминокислот, отличных от пролина
-
Полипролиновая спираль I (PPI)
- Правосторонняя спираль с двугранными углами (-75°, 160°) и цис-изомерными пептидными связями
- Менее плотная, чем PPII, с 3,3 остатками на виток и подъемом на остаток 1,9 Å
-
Структурные свойства
- PPII считался жестким, использовался в структурной биологии
- Исследования показали, что полипролин менее жесткий, чем предполагалось
- Взаимопревращения между PPII и PPI медленные, катализируются пролилизомеразами
- Исследования выявили промежуточные продукты в процессе изомеризации